More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32340 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 
264 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  81.4 
 
 
259 aa  403  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  77.31 
 
 
255 aa  357  9.999999999999999e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  75.83 
 
 
312 aa  347  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  73.06 
 
 
302 aa  343  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  69.29 
 
 
288 aa  342  2.9999999999999997e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  66.81 
 
 
247 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  65.53 
 
 
253 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  65.7 
 
 
256 aa  318  7e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  65.11 
 
 
455 aa  311  6.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  63.71 
 
 
258 aa  311  7.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  62.82 
 
 
280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  61.13 
 
 
252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  62.96 
 
 
277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  64.35 
 
 
256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  65.04 
 
 
258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  63.07 
 
 
262 aa  301  6.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  64.76 
 
 
445 aa  300  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  62.17 
 
 
258 aa  300  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  62.87 
 
 
277 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  63.25 
 
 
250 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  63.2 
 
 
266 aa  299  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  64.76 
 
 
244 aa  299  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  62.13 
 
 
291 aa  299  3e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.04 
 
 
274 aa  298  6e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  62.18 
 
 
263 aa  298  7e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  60.08 
 
 
255 aa  297  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  63.48 
 
 
255 aa  297  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  63.48 
 
 
255 aa  296  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  62.13 
 
 
264 aa  296  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  62.93 
 
 
261 aa  296  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  58.97 
 
 
271 aa  294  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  62.5 
 
 
255 aa  291  7e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  60.58 
 
 
258 aa  291  8e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  62.18 
 
 
247 aa  291  9e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  66.22 
 
 
253 aa  291  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  61.47 
 
 
268 aa  290  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
279 aa  285  4e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  65.49 
 
 
257 aa  285  7e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  58.95 
 
 
269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  62.92 
 
 
258 aa  278  8e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  56.73 
 
 
279 aa  277  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  63.68 
 
 
250 aa  275  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  57.96 
 
 
245 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  59.24 
 
 
277 aa  270  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  58.3 
 
 
243 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  57.76 
 
 
266 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  57.45 
 
 
255 aa  263  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  55.51 
 
 
245 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  59.64 
 
 
249 aa  260  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  56.71 
 
 
243 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  58.45 
 
 
252 aa  259  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  58.01 
 
 
257 aa  258  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  57.02 
 
 
256 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  56.17 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  55.6 
 
 
241 aa  249  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  49.8 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  55.74 
 
 
271 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  50.94 
 
 
228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  54.26 
 
 
272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  50.22 
 
 
244 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  53.6 
 
 
248 aa  230  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.48 
 
 
266 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  47.73 
 
 
225 aa  228  7e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  49.08 
 
 
227 aa  228  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  50.42 
 
 
279 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  43.22 
 
 
240 aa  226  4e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  48.34 
 
 
225 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  55.65 
 
 
249 aa  222  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  56.47 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  49.56 
 
 
240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  47.14 
 
 
229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.18 
 
 
226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  44.55 
 
 
230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  55.67 
 
 
224 aa  218  6e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  44.12 
 
 
246 aa  218  7e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  49.54 
 
 
235 aa  217  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  46.64 
 
 
228 aa  217  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  46.9 
 
 
252 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  46.9 
 
 
252 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  46.7 
 
 
229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  44.8 
 
 
293 aa  216  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0841  ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 
255 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.598404  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.34 
 
 
269 aa  216  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  49.15 
 
 
233 aa  215  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.36 
 
 
230 aa  215  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  51.29 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  45.98 
 
 
227 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  46.02 
 
 
231 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  50.88 
 
 
239 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  45.95 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  45.34 
 
 
252 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.69 
 
 
225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 
231 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03360  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.02 
 
 
255 aa  212  5.999999999999999e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.922204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  43.35 
 
 
238 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  47.21 
 
 
251 aa  211  7e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  50.45 
 
 
563 aa  211  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  48.71 
 
 
255 aa  211  7e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  48.61 
 
 
225 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>