More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31540 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 458 aa  929    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  40.19 
 
 		 429 aa  301  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  37.3 
 
 		 429 aa  276  5e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  32.69 
 
 		 425 aa  234  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  32.71 
 
 		 424 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  28.99 
 
 		 423 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  25.5 
 
 		 410 aa  114  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  27.81 
 
 		 413 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.81 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 427 aa  103  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 461 aa  100  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  29.14 
 
 		 429 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 408 aa  95.5  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 439 aa  92.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 408 aa  92  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 424 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 419 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 417 aa  90.9  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.31 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 458 aa  87  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  28.08 
 
 		 419 aa  86.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.49 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  28.28 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6532  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 427 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0178193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.8 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.61 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.33 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3675  extracellular solute-binding protein family 1  28.13 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1597  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  26.01 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.67 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0115  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132691  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  27.15 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 418 aa  73.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  29.58 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.51 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  31.82 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.51 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  21.55 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 470 aa  70.1  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  22.7 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  25.21 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  33.66 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 422 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 412 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.96 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1947  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.709657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.94 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  30.84 
 
 		 463 aa  66.2  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  31.76 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>