20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31470 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_31470  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00321692  normal  0.396468 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2050  hypothetical protein  77.08 
 
 
192 aa  313  9.999999999999999e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2936  hypothetical protein  76.76 
 
 
186 aa  295  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0841  hypothetical protein  77.05 
 
 
197 aa  289  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.296709  normal  0.340088 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2411  hypothetical protein  69.06 
 
 
187 aa  259  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0262472  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4317  hypothetical protein  64.48 
 
 
193 aa  241  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681233  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08430  hypothetical protein  63.59 
 
 
190 aa  231  5e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.220757  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31700  hypothetical protein  58.6 
 
 
182 aa  207  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00970  Protein of unknown function DUF88  53.23 
 
 
182 aa  185  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0244  hypothetical protein  53.07 
 
 
189 aa  167  8e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.530427  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10209  hypothetical protein  29.05 
 
 
242 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000202776  normal  0.512933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0365  hypothetical protein  30.48 
 
 
221 aa  55.1  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0717051  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1483  hypothetical protein  32.37 
 
 
259 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15064  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4480  hypothetical protein  31.58 
 
 
230 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139036  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0455  hypothetical protein  27.23 
 
 
237 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0161  hypothetical protein  30.39 
 
 
232 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351548  normal  0.187637 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0181  hypothetical protein  30.39 
 
 
232 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0172  hypothetical protein  30.39 
 
 
232 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0072  hypothetical protein  27.37 
 
 
268 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0197  hypothetical protein  28.12 
 
 
239 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.513429  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>