More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30790 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 
378 aa  753    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  67.65 
 
 
372 aa  520  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  71.28 
 
 
393 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  64.42 
 
 
375 aa  498  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  64.13 
 
 
373 aa  495  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  65.95 
 
 
376 aa  488  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  64.85 
 
 
370 aa  486  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  63.22 
 
 
376 aa  481  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  65.34 
 
 
372 aa  482  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  63.83 
 
 
376 aa  481  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  66.12 
 
 
371 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  62.02 
 
 
370 aa  475  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  65.12 
 
 
375 aa  476  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  64.15 
 
 
374 aa  475  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  64.77 
 
 
395 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  62.74 
 
 
376 aa  472  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  66.04 
 
 
379 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  60.82 
 
 
376 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  63.98 
 
 
374 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  62.4 
 
 
387 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  62.2 
 
 
369 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  59.89 
 
 
374 aa  462  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  60.38 
 
 
377 aa  463  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  60.93 
 
 
370 aa  457  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  59.06 
 
 
381 aa  461  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  61.02 
 
 
377 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  65.12 
 
 
370 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  65.12 
 
 
370 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  65.12 
 
 
370 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  59.08 
 
 
373 aa  451  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  66.49 
 
 
378 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  64.4 
 
 
385 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  61.68 
 
 
374 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  59.19 
 
 
375 aa  431  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  58.05 
 
 
380 aa  430  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  58.65 
 
 
417 aa  430  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  60.11 
 
 
369 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  52.19 
 
 
382 aa  382  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  43.05 
 
 
373 aa  287  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  27.65 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  26.05 
 
 
361 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  28.3 
 
 
357 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  26 
 
 
357 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  25.07 
 
 
360 aa  97.8  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  28.26 
 
 
375 aa  97.4  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  27.27 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1381  phosphoserine aminotransferase  27.37 
 
 
391 aa  92.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.705513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  26.89 
 
 
352 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  24.51 
 
 
346 aa  92  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  23.97 
 
 
358 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0260  phosphoserine aminotransferase  27.6 
 
 
389 aa  90.1  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  23.97 
 
 
358 aa  90.1  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0555  phosphoserine aminotransferase  28.28 
 
 
410 aa  89.7  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  26.94 
 
 
357 aa  89.4  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  28.8 
 
 
373 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  27.7 
 
 
370 aa  87.8  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6961  phosphoserine aminotransferase  27.03 
 
 
399 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  24.79 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1759  phosphoserine aminotransferase  26.86 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  26.92 
 
 
357 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  25 
 
 
355 aa  84  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1351  phosphoserine aminotransferase  26.61 
 
 
385 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0019  phosphoserine aminotransferase  26.61 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625481  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1687  phosphoserine aminotransferase  27.47 
 
 
391 aa  82  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  29.12 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1631  phosphoserine aminotransferase  27.47 
 
 
391 aa  82  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0508  phosphoserine aminotransferase  24.53 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.957618  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  26 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  26.8 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0009  phosphoserine aminotransferase  27.67 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1270  phosphoserine aminotransferase  26.56 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3317  phosphoserine aminotransferase  27.75 
 
 
384 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3162  phosphoserine aminotransferase  27.81 
 
 
390 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1228  phosphoserine aminotransferase  27.25 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.858979  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  26.42 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  25.5 
 
 
359 aa  77  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  24.21 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  24.79 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1278  phosphoserine aminotransferase  23.53 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4686  phosphoserine aminotransferase  25.88 
 
 
385 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0966475  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3596  phosphoserine aminotransferase  26.56 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0813  phosphoserine aminotransferase  27.27 
 
 
384 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  26.8 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1332  phosphoserine aminotransferase  24.44 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1118  phosphoserine aminotransferase  25.86 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.837238  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42458  phosphoserine transaminase  23.73 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.809086  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2969  phosphoserine aminotransferase  25.07 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1373  phosphoserine aminotransferase  22.69 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2651  phosphoserine aminotransferase  24.73 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311061  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3625  phosphoserine aminotransferase  25.13 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0111727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0617  phosphoserine aminotransferase  25.53 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2708  phosphoserine aminotransferase  25.52 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2679  phosphoserine aminotransferase  25.88 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  22.67 
 
 
360 aa  72  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2803  phosphoserine aminotransferase  25.52 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.128725  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1369  phosphoserine aminotransferase  23.68 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0619  phosphoserine aminotransferase  21.04 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0477  phosphoserine aminotransferase  25.13 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108745 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0295  phosphoserine aminotransferase  23.76 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000953711  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  24.32 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.828451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>