More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30750 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 		 305 aa  597  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  65.13 
 
 		 317 aa  390  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  65.68 
 
 		 308 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  66.11 
 
 		 310 aa  364  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  68.65 
 
 		 305 aa  362  3e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  43.55 
 
 		 345 aa  223  4e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  43.93 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  47.21 
 
 		 343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  45.16 
 
 		 348 aa  186  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  40.07 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 289 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  36.6 
 
 		 293 aa  148  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  36.91 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  38.05 
 
 		 277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  36.96 
 
 		 288 aa  136  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  36.3 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  36.39 
 
 		 293 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  33.44 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  33.44 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  39.41 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  33.44 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  38.11 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 296 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  35.29 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  34.98 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  32.57 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  41.75 
 
 		 284 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  35.69 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  35.69 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  35.53 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 		 287 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  36.12 
 
 		 293 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  36.12 
 
 		 293 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  36.12 
 
 		 293 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  35.55 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  35.55 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  38.06 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  35.22 
 
 		 292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  36.09 
 
 		 277 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  37.71 
 
 		 285 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.1 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  36.27 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 		 381 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  32.15 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  33.22 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  31.83 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.31 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  31.83 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  34.52 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  36.07 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  34.77 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  36.42 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  37.5 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  33.99 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  40.27 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  35.64 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  37.62 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  31.91 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  36.84 
 
 		 298 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 		 298 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 		 298 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  36.95 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  34.47 
 
 		 277 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  36.07 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  35.62 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 293 aa  106  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  36.12 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  35.69 
 
 		 293 aa  104  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  33.66 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  32.69 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  33.76 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  33.66 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  37.37 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  32.92 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  30.59 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  32.26 
 
 		 289 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 289 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  32.04 
 
 		 347 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30980  universal stress protein UspA-like protein  37.71 
 
 		 334 aa  96.7  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.34325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  32.21 
 
 		 301 aa  96.3  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  35.91 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  32.78 
 
 		 298 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  33.54 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  30.92 
 
 		 287 aa  93.6  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  29.47 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  35.69 
 
 		 282 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  32.79 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  29.63 
 
 		 315 aa  92.8  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>