More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30340 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_30340  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 
546 aa  1122    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20854  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2731  methionyl-tRNA synthetase  78.61 
 
 
541 aa  846    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.299776  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  76.08 
 
 
538 aa  845    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0175  methionyl-tRNA synthetase  66.29 
 
 
539 aa  726    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.7084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  67.23 
 
 
530 aa  740    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
648 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
651 aa  495  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
509 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
650 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
632 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
654 aa  491  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
512 aa  485  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07450  methionyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
526 aa  486  1e-136  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.988423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
510 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
509 aa  480  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
509 aa  480  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
511 aa  478  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
508 aa  479  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
533 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
655 aa  478  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
650 aa  476  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 
671 aa  478  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 
518 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 
647 aa  472  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
509 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 
653 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2661  methionyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
529 aa  470  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.539364 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
653 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04890  methionyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
526 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.733065  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
634 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0529  methionyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
503 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0742332  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
645 aa  463  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 
511 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
516 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
634 aa  456  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
645 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 
645 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
628 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5259  methionyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
501 aa  451  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
629 aa  451  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
660 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
629 aa  451  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
660 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
660 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
660 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
647 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
645 aa  448  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
660 aa  444  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
660 aa  445  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
660 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
660 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 
516 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1583  methionyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
517 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
660 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
648 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
660 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
659 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2008  methionyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 
659 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0838931  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
650 aa  436  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1990  methionyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 
516 aa  435  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.950976  hitchhiker  0.0073495 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
665 aa  432  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
515 aa  432  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1534  methionyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 
530 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1462  methionyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 
544 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
519 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
638 aa  434  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
515 aa  432  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 
722 aa  432  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 
535 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3113  methionyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
520 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1459  methionyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
500 aa  431  1e-119  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1802  methionyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
516 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
515 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 
535 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
648 aa  429  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1085  methionyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
536 aa  426  1e-118  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
512 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
656 aa  424  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2158  methionyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
525 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.99655  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
681 aa  422  1e-117  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2273  methionyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
519 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000444544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
514 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2723  methionyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
530 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.148224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
515 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 
675 aa  421  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 
657 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1142  methionyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
525 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.873399  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 
657 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4858  methionyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
533 aa  416  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000526962  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0820  methionyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
519 aa  416  9.999999999999999e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0770055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 
654 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4327  methionyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
550 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2705  methionyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
522 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2717  methionyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
514 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1806  methionyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
530 aa  415  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000579293 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2533  methionyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
519 aa  415  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308491  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2681  methionyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
514 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4266  methionyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
515 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.345625  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4803  methionyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
511 aa  411  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688062  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>