18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30080 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30080  hypothetical protein  100 
 
 		 616 aa  1115    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.798837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2253  hypothetical protein  47.4 
 
 		 617 aa  432  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3118  hypothetical protein  54.6 
 
 		 594 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.092965  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1136  hypothetical protein  47.28 
 
 		 598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0147757  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1135  hypothetical protein  46.46 
 
 		 579 aa  345  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00673541  hitchhiker  0.000103654 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2307  hypothetical protein  39.82 
 
 		 644 aa  336  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000320595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0131  hypothetical protein  28.93 
 
 		 644 aa  280  5e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153652  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1903  hypothetical protein  37.81 
 
 		 628 aa  279  9e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0294  hypothetical protein  35.17 
 
 		 654 aa  231  4e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03560  hypothetical protein  33.12 
 
 		 676 aa  213  7.999999999999999e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0660497  normal  0.0241911 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3227  hypothetical protein  41.16 
 
 		 534 aa  206  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0626  hypothetical protein  29.84 
 
 		 504 aa  171  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2159  hypothetical protein  33.04 
 
 		 286 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  31.01 
 
 		 537 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23850  hypothetical protein  32.92 
 
 		 460 aa  125  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0149528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3210  hypothetical protein  49.22 
 
 		 592 aa  103  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.575907  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0376  hypothetical protein  27.76 
 
 		 742 aa  100  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0094  hypothetical protein  32.54 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>