43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29950 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29950  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  326  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0573  protoporphyrinogen oxidase  63.19 
 
 		 167 aa  211  4.9999999999999996e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307777 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2409  protoporphyrinogen oxidase  47.8 
 
 		 181 aa  139  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136205  normal  0.0149961 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2554  Flavodoxin-like protein  46.15 
 
 		 169 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2108  flavodoxin-like protein  43.75 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0677138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1632  flavodoxin-like protein  39.53 
 
 		 193 aa  88.6  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1824  flavodoxin  32.91 
 
 		 168 aa  87.8  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3023  flavodoxin  38.65 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1685  flavodoxin  35.26 
 
 		 172 aa  84  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0906832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2314  flavodoxin-like  38.89 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403811  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2438  Flavodoxin-like protein  39.13 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000794828  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1410  Flavodoxin-like protein  29.27 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00810371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  32.69 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2492  flavodoxin-like protein  32.9 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2375  flavodoxin  36.14 
 
 		 173 aa  70.5  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.185264  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0168  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.55 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3245  flavodoxin-like protein  35.33 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19080  flavodoxin  32.68 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00340  flavodoxin  34.62 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3662  hypothetical protein  33.83 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.35074  normal  0.580287 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2562  Flavodoxin-like protein  27.95 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1699  flavodoxin  28.14 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4320  protoporphyrinogen oxidase  32.22 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000364139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4369  protoporphyrinogen oxidase  32.22 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000843735  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03690  hypothetical protein  32.22 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000962205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4131  Protoporphyrinogen oxidase  32.22 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000348526  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4231  protoporphyrinogen oxidase  32.22 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000133684  normal  0.0229749 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03741  protoporphyrin oxidase, flavoprotein  32.22 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00160389  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4073  protoporphyrinogen oxidase  32.22 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4160  protoporphyrinogen oxidase  32.22 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000131743  decreased coverage  0.00000239257 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5289  protoporphyrinogen oxidase  32.22 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000241436  normal  0.0811334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3601  protoporphyrinogen oxidase  36.59 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.934061  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4194  protoporphyrinogen oxidase  28.28 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000219448  normal  0.630031 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4313  protoporphyrinogen oxidase  28.28 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000309624  normal  0.107941 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4266  protoporphyrinogen oxidase  28.28 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000166727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3743  protoporphyrinogen oxidase  31.87 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000514113  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4217  protoporphyrinogen oxidase  28.28 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000339833  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4373  protoporphyrinogen oxidase  28.28 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000903845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0077  flavodoxin-like protein  20.2 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2461  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.95 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00792569  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3336  protoporphyrinogen oxidase  35 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1487  protoporphyrinogen oxidase  25.95 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.040472  hitchhiker  0.00766519 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3945  protoporphyrinogen oxidase  30.49 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000851494  decreased coverage  0.00158179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>