82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29770 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  532  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  37.6 
 
 		 347 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  35.91 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  35.04 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0286  hypothetical protein  31.6 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.141082 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  33.9 
 
 		 331 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  32 
 
 		 310 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  34.06 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  37.55 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  33.2 
 
 		 374 aa  85.5  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  35.56 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  36.33 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  37.24 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  36.08 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  33.47 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  33.17 
 
 		 329 aa  75.5  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  36.76 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  33.61 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  32.33 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  32.49 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  35.87 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  32.2 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3059  hypothetical protein  34.55 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  30.58 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  31.84 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  31.84 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  31.84 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  65.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  33.55 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  33.55 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  34.94 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  29.44 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  29.74 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1692  hypothetical protein  34.5 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04430  hypothetical protein  46.15 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4094  hypothetical protein  32.18 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.811217  normal  0.0134077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  30.25 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  36.59 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16560  hypothetical protein  27.14 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  37.1 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  32.39 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  34.09 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  29.63 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1742  hypothetical protein  34.9 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0302  hypothetical protein  53.97 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  31.22 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0217  hypothetical protein  32 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  31.13 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  30.87 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  32.99 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  33.52 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  31.36 
 
 		 309 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  35.25 
 
 		 337 aa  52.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  34.43 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  30.5 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  29.51 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  29.51 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  30.53 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  30.53 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27230  hypothetical protein  29.62 
 
 		 321 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  31.53 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  30.53 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  30.65 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  31.15 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  32.28 
 
 		 284 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  32.28 
 
 		 284 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  32.28 
 
 		 284 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22240  hypothetical protein  32.89 
 
 		 375 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.527189  normal  0.11385 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  32.65 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  31.67 
 
 		 300 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  31.67 
 
 		 300 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  36.09 
 
 		 328 aa  46.6  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  31.67 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  27.32 
 
 		 330 aa  46.6  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  33.58 
 
 		 289 aa  45.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0574  hypothetical protein  37.14 
 
 		 142 aa  45.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0467384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  27.73 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  26.49 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  26.28 
 
 		 379 aa  43.5  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2812  hypothetical protein  31.3 
 
 		 261 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437661  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  27.7 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>