285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29660 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29660  LSU ribosomal protein L29P  100 
 
 		 79 aa  159  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2651  ribosomal protein L29  90.91 
 
 		 78 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0635  ribosomal protein L29  84.42 
 
 		 78 aa  137  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0595  ribosomal protein L29  82.28 
 
 		 79 aa  132  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.978354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3135  ribosomal protein L29  81.58 
 
 		 79 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2679  ribosomal protein L29  76.25 
 
 		 109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2967  50S ribosomal protein L29P  73.75 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115661  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17080  LSU ribosomal protein L29P  70.83 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00253403  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  67.09 
 
 		 83 aa  104  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  69.44 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1094  50S ribosomal protein L29  64.38 
 
 		 78 aa  94  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  67.19 
 
 		 80 aa  92  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1715  50S ribosomal protein L29  58.23 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0262  ribosomal protein L29  58.23 
 
 		 83 aa  90.5  8e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  61.97 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  59.15 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  61.76 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  60.53 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  55.7 
 
 		 77 aa  84  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  58.33 
 
 		 83 aa  84  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  61.43 
 
 		 83 aa  83.6  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  55.26 
 
 		 77 aa  83.6  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  60.29 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  51.9 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  59.15 
 
 		 74 aa  82.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  51.9 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  51.9 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  57.58 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  55.84 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  53.85 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  58.46 
 
 		 76 aa  80.1  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  53.95 
 
 		 77 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  52.63 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  61.67 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4307  50S ribosomal protein L29  61.82 
 
 		 78 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243874  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  52.31 
 
 		 80 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3915  50S ribosomal protein L29  61.82 
 
 		 78 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4018  50S ribosomal protein L29  59.38 
 
 		 66 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186553  hitchhiker  0.00000457744 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  57.81 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1177  50S ribosomal protein L29  56.25 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267445  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6606  ribosomal protein L29  57.69 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  56.25 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0961  50S ribosomal protein L29  50.77 
 
 		 66 aa  70.1  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00226195  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  56.92 
 
 		 69 aa  70.1  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 68 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  53.85 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  53.85 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 68 aa  65.5  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  50 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  58.49 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  50.75 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 72 aa  63.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  47.62 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  47.69 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  61.54 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  44.62 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  59.62 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  54.84 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  57.63 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  51.67 
 
 		 67 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 69 aa  62  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  57.89 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  50.82 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  49.21 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  71.05 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  65.12 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  65.12 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  65.12 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  56.36 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  56.36 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  65.12 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  65.12 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  65.12 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  65.12 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  65.12 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  65.12 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  65.12 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  54.1 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  54.1 
 
 		 66 aa  60.1  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  54.1 
 
 		 66 aa  60.1  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  52.54 
 
 		 71 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  46.03 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0345  ribosomal protein L29  52.54 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  57.69 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  52.54 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  43.48 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  52.54 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  52.54 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>