More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29610 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_29610  SSU ribosomal protein S14P  100 
 
 
61 aa  126  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.975596 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0640  ribosomal protein S14  96.72 
 
 
61 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196162  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2646  ribosomal protein S14  96.72 
 
 
61 aa  124  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0600  ribosomal protein S14  93.44 
 
 
61 aa  123  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.516663  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6601  ribosomal protein S14  88.52 
 
 
61 aa  118  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4494  ribosomal protein S14  86.89 
 
 
61 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0944  ribosomal protein S14  86.89 
 
 
61 aa  114  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23670  SSU ribosomal protein S14P  85.25 
 
 
61 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143448  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264a  30S ribosomal protein S14  90.16 
 
 
61 aa  114  5e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0319  30S ribosomal protein S14  86.89 
 
 
61 aa  114  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0032985 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3710  ribosomal protein S14  86.89 
 
 
61 aa  113  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4302  30S ribosomal protein S14  83.61 
 
 
61 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604005  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1720  30S ribosomal protein S14  88.52 
 
 
61 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3910  30S ribosomal protein S14  83.61 
 
 
61 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229481  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20740  30S ribosomal protein S14  86.89 
 
 
61 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.905824 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10731  30S ribosomal protein S14  86.89 
 
 
61 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.606007 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3418  ribosomal protein S14  85.25 
 
 
61 aa  111  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0701  ribosomal protein S14  83.61 
 
 
61 aa  110  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1057  30S ribosomal protein S14  83.61 
 
 
61 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0000711569  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1028  30S ribosomal protein S14  83.61 
 
 
61 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000000564921  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1045  30S ribosomal protein S14  83.61 
 
 
61 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000910706  normal  0.188139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6036  30S ribosomal protein S14  83.61 
 
 
61 aa  110  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1198  30S ribosomal protein S14  80.33 
 
 
61 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0428154 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3892  SSU ribosomal protein S14P  85.25 
 
 
61 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1136  ribosomal protein S14  81.97 
 
 
61 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5034  30S ribosomal protein S14  81.97 
 
 
61 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000580616  normal  0.481269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1335  30S ribosomal protein S14  81.97 
 
 
61 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148473  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04110  SSU ribosomal protein S14P  78.69 
 
 
61 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5137  ribosomal protein S14  77.05 
 
 
61 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.410721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2633  SSU ribosomal protein S14P  80.33 
 
 
61 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0670776  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0595  30S ribosomal protein S14  77.05 
 
 
61 aa  104  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0575  30S ribosomal protein S14  80.33 
 
 
61 aa  104  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3130  ribosomal protein S14  78.69 
 
 
61 aa  104  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0411  ribosomal protein S14  77.05 
 
 
61 aa  102  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1099  ribosomal protein S14  78.69 
 
 
61 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23340  SSU ribosomal protein S14P  68.85 
 
 
61 aa  99.4  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000971203  hitchhiker  0.00000013579 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2698  ribosomal protein S14  70.49 
 
 
61 aa  98.2  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1955  ribosomal protein S14  70.49 
 
 
61 aa  97.4  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2894  ribosomal protein S14  68.85 
 
 
61 aa  96.3  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1764  30S ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  95.9  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000826502  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0120  30S ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0124  30S ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0072  30S ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  95.9  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.15286  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1862  30S ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  95.1  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1691  30S ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  95.1  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.049488  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2068  30S ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  95.1  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0860  SSU ribosomal protein S14P  67.21 
 
 
61 aa  94.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00017465  hitchhiker  0.00181207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4308  ribosomal protein S14  87.5 
 
 
61 aa  94  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.442038  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1894  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  94  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000079988  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1818  30S ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  93.6  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1148  ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  92.8  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000324715  hitchhiker  0.00150384 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0047  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  92.8  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.585329  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0144  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000518552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0123  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000176609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0117  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  92.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0123  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0119  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6855200000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0117  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000493701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0118  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000039135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0154  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0123  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064934  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0299  30S ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  92  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0322273  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2305  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  92  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00385731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5182  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220128  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0135  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2264  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  92  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00143207  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1020  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  92  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00305455  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09870  SSU ribosomal protein S14P  62.3 
 
 
61 aa  91.3  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000893021  hitchhiker  0.0000177439 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2389  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  91.3  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000019589  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2165  ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  91.3  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0123488  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0071  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  90.9  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.689947  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2320  ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  90.5  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000205328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0228  ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229015  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1470  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  88.6  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000297211  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2386  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 
74 aa  87.4  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2701  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0207  SSU ribosomal protein S14P  62.3 
 
 
61 aa  87  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00665329  normal  0.463134 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2447  SSU ribosomal protein S14P  65.57 
 
 
61 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1568  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.837036  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0435  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000657507  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf429  ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  85.5  2e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0777  ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  85.5  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0771  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000576242  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0097  ribosomal protein S14p/S29e  59.02 
 
 
61 aa  85.1  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.316233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2916  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  84.3  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224414  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4927  ribosomal protein S14  59.02 
 
 
61 aa  84  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000398171  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1752  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0092  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0813012 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0728  ribosomal protein S14  59.02 
 
 
61 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2142  SSU ribosomal protein S14P  59.02 
 
 
61 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21315  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1405  ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0239  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 
61 aa  83.6  0.000000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0721  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.152627  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0673  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.676771  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2052  ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0017138  normal  0.052251 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1125  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  82  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.128542  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1561  ribosomal protein S14  59.02 
 
 
61 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000971035  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2244  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00320341  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0683  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  81.3  0.000000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1172  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992885  normal  0.180837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>