More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29230 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_29230  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  100 
 
 
224 aa  434  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  56.19 
 
 
241 aa  198  7e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  48.21 
 
 
229 aa  176  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2598  peptidase M22 glycoprotease  53.66 
 
 
229 aa  176  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0896201  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3663  peptidase M22, glycoprotease  45.33 
 
 
212 aa  148  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3071  peptidase M22 glycoprotease  46.22 
 
 
222 aa  142  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.255887  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4263  peptidase M22 glycoprotease  48.82 
 
 
230 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07480  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  44.44 
 
 
225 aa  137  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.308206  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1000  peptidase M22 glycoprotease  44.84 
 
 
218 aa  135  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2894  peptidase M22, glycoprotease  42.25 
 
 
223 aa  135  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6007  peptidase M22 glycoprotease  40.41 
 
 
287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.463097  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  41.43 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0627  peptidase M22, glycoprotease  46.64 
 
 
254 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2604  peptidase M22 glycoprotease  43.9 
 
 
223 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000523525 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0358  peptidase M22, glycoprotease  43.14 
 
 
216 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0837171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0562  peptidase M22 glycoprotease  43.75 
 
 
218 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.849533  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23140  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  42.99 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1714  peptidase M22 glycoprotease  43.52 
 
 
243 aa  119  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4043  peptidase M22 glycoprotease  42.44 
 
 
225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0614  peptidase M22 glycoprotease  41.35 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725915  normal  0.446641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1146  peptidase M22 glycoprotease  38.24 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3853  peptidase M22, glycoprotease  44.83 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0731  peptidase M22 glycoprotease  46.3 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0874562  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1487  peptidase M22, glycoprotease  41.43 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6548  peptidase M22 glycoprotease  42.79 
 
 
232 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4243  peptidase M22 glycoprotease  44.34 
 
 
225 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0145677 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0883  peptidase M22 glycoprotease  40.91 
 
 
191 aa  109  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0111529  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04630  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  38.6 
 
 
207 aa  109  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47382  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1149  peptidase M22, glycoprotease  41.63 
 
 
211 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1166  peptidase M22, glycoprotease  41.63 
 
 
211 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.533647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1176  peptidase M22, glycoprotease  41.35 
 
 
211 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0451061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4457  peptidase M22 glycoprotease  40 
 
 
212 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4931  peptidase M22, glycoprotease  41.9 
 
 
210 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1202  peptidase M22 glycoprotease  39.07 
 
 
248 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  37.91 
 
 
238 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13455  hypothetical protein  40.87 
 
 
215 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00396413  hitchhiker  0.000602893 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  34.01 
 
 
233 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  34.15 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16700  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  41.96 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.568455  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  33.8 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  33.48 
 
 
233 aa  89.4  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  34.69 
 
 
234 aa  89.4  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  28.51 
 
 
236 aa  89.4  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  32.99 
 
 
237 aa  89  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  33.03 
 
 
233 aa  89  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  30.77 
 
 
236 aa  88.2  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  30.7 
 
 
231 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  30.7 
 
 
231 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  30.7 
 
 
231 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  30.7 
 
 
231 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  30.7 
 
 
231 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  30.45 
 
 
231 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  30.45 
 
 
231 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  33.03 
 
 
233 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  32.14 
 
 
238 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  30.45 
 
 
231 aa  86.3  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  36.73 
 
 
233 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  28.96 
 
 
223 aa  85.9  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  30.51 
 
 
239 aa  85.5  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  32.66 
 
 
238 aa  85.5  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  30.26 
 
 
232 aa  85.1  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  30.26 
 
 
232 aa  85.1  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3738  peptidase M22 glycoprotease  40.37 
 
 
241 aa  85.1  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  30.26 
 
 
232 aa  85.1  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  29.36 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1747  glycoprotein endopeptidase  32.87 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.3762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1857  peptidase M22 glycoprotease  33.82 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00567012  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  30.7 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  30.61 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  30.61 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  30.61 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0939  hypothetical protein  32.19 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  30.81 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  32.14 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  30.29 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  30.59 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  30.61 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  32.64 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  30.61 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  34.52 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  32.32 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  32.32 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  34.36 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11790  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.04 
 
 
860 aa  81.6  0.000000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  42.86 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  38.02 
 
 
235 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  31.12 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  32.88 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  33.55 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0280  hypothetical protein  32.52 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  28.88 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  31.4 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0309  hypothetical protein  32.52 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  34.43 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0233  O-sialoglycoprotein endopeptidase (glycoprotease)  32.52 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  34.7 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  39.29 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  33.51 
 
 
220 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0285  hypothetical protein  32.52 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1257  peptidase M22 glycoprotease  31.07 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.924937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>