More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28700 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  100 
 
 		 97 aa  188  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  89.58 
 
 		 98 aa  171  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  87.63 
 
 		 97 aa  170  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  87.63 
 
 		 97 aa  170  6.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  89.58 
 
 		 97 aa  169  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  86.46 
 
 		 97 aa  163  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  85.42 
 
 		 98 aa  163  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0735  co-chaperonin GroES  88.3 
 
 		 98 aa  162  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224017  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  83.33 
 
 		 97 aa  160  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  81.91 
 
 		 102 aa  155  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  82.98 
 
 		 102 aa  155  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  80.21 
 
 		 98 aa  155  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  81.25 
 
 		 98 aa  155  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  81.91 
 
 		 104 aa  155  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  82.8 
 
 		 103 aa  154  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  80.85 
 
 		 102 aa  153  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  76.04 
 
 		 98 aa  149  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2887  co-chaperonin GroES  80.21 
 
 		 97 aa  149  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0300428  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  77.08 
 
 		 99 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2595  co-chaperonin GroES  79.17 
 
 		 97 aa  148  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000536943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  77.08 
 
 		 127 aa  146  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1153  chaperonin Cpn10  77.08 
 
 		 127 aa  146  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  77.08 
 
 		 127 aa  146  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  76.84 
 
 		 103 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  76.84 
 
 		 100 aa  144  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  69.07 
 
 		 97 aa  144  5e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4925  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 		 100 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1494  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 		 100 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1207  chaperonin Cpn10  76.34 
 
 		 99 aa  143  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.867572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  78.72 
 
 		 101 aa  142  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  68.04 
 
 		 97 aa  142  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  77.66 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07560  Co-chaperonin GroES  74.47 
 
 		 98 aa  142  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371401  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  78.72 
 
 		 101 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  75.79 
 
 		 103 aa  137  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1007  chaperonin Cpn10  73.96 
 
 		 98 aa  137  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  74.74 
 
 		 104 aa  136  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  68.75 
 
 		 99 aa  136  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  68.42 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 94 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 		 96 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 96 aa  124  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  67.39 
 
 		 94 aa  124  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  65.22 
 
 		 94 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 94 aa  123  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  66.67 
 
 		 97 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  62.11 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 94 aa  121  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 94 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 94 aa  121  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 94 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 94 aa  121  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 94 aa  121  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 94 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 94 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 94 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  66.3 
 
 		 94 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  61.96 
 
 		 95 aa  121  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 98 aa  121  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  63.44 
 
 		 94 aa  120  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  64.13 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  60.22 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  57.73 
 
 		 97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  61.54 
 
 		 94 aa  116  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 95 aa  116  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 97 aa  116  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2574  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2276  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0587  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 98 aa  115  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0674011  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  54.17 
 
 		 98 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  52.08 
 
 		 98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0564  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  60.22 
 
 		 100 aa  114  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 96 aa  114  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 98 aa  113  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 98 aa  113  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 95 aa  113  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  51.04 
 
 		 98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  56.25 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1212  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.694559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0183  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0482  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>