More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28610 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 333 aa  631  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  56.76 
 
 		 315 aa  318  6e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  48.65 
 
 		 313 aa  260  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  45.51 
 
 		 325 aa  242  7e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  44.74 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  47.08 
 
 		 325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  43.81 
 
 		 336 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  47.32 
 
 		 319 aa  196  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  46.11 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  44.85 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  46.62 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  42.99 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  39.94 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  39.94 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  39.94 
 
 		 325 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0081  PfkB  41.07 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0457404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0090  ribokinase-like domain-containing protein  41.07 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0071  ribokinase-like domain-containing protein  41.07 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.897309  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  38.46 
 
 		 312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  37.54 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0185  1-phosphofructokinase  43.03 
 
 		 323 aa  153  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0300  ribokinase-like domain-containing protein  43.31 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  36.51 
 
 		 319 aa  152  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  42.55 
 
 		 315 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  35.78 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  42.09 
 
 		 327 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  33.12 
 
 		 310 aa  145  9e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  39.73 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  37.83 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  32.91 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  38.24 
 
 		 318 aa  143  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  32.8 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4987  ribokinase-like domain-containing protein  38.2 
 
 		 315 aa  142  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  35.76 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  39.73 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  36.57 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  31.25 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  36.7 
 
 		 303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  38.35 
 
 		 314 aa  139  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  33.87 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  34.42 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  32.56 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  35.21 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4851  1-phosphofructokinase  40.3 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440594  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  40.61 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  33.65 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  37.85 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  37.45 
 
 		 303 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  34.96 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  34.96 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  36.33 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  36.33 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  33.76 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  36.68 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  36.33 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  36.33 
 
 		 303 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  39.48 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  39.48 
 
 		 317 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  38.6 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  34.81 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  31.27 
 
 		 309 aa  135  9e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  31.85 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  31.48 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  36.19 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  28.35 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  36.19 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  36.19 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  36.19 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  36.19 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  36.19 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0526  1-phosphofructokinase  41.81 
 
 		 330 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  31.06 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0907  1-phosphofructokinase  39.26 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  32.06 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  36.19 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  32.23 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  31.56 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  31.56 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  35.87 
 
 		 309 aa  132  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  31.16 
 
 		 310 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  39.3 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  35.87 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22310  1-phosphofructokinase  37.57 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  34.28 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  34.7 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  30.1 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  34.29 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  36.16 
 
 		 303 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  31.48 
 
 		 307 aa  129  9.000000000000001e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  38.31 
 
 		 316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  33.02 
 
 		 332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  35.44 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  38.08 
 
 		 310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  33.12 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  37.69 
 
 		 310 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  37.8 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  37.69 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  37.69 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  38.6 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>