237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28260 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  67.91 
 
 		 584 aa  698    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  68.76 
 
 		 558 aa  694    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  68.99 
 
 		 580 aa  685    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  78.77 
 
 		 535 aa  761    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  100 
 
 		 580 aa  1151    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  73.9 
 
 		 499 aa  703    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  44.28 
 
 		 530 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  49.35 
 
 		 551 aa  381  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  66.67 
 
 		 605 aa  333  4e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  39.25 
 
 		 508 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  36.97 
 
 		 556 aa  228  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  55.12 
 
 		 628 aa  227  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  39.24 
 
 		 507 aa  221  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  34.36 
 
 		 585 aa  205  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  37.91 
 
 		 566 aa  202  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  34.27 
 
 		 620 aa  197  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  35.92 
 
 		 568 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  38.6 
 
 		 602 aa  183  8.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  36.07 
 
 		 603 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  52.59 
 
 		 714 aa  143  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  46.56 
 
 		 222 aa  124  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  28.53 
 
 		 567 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  30.56 
 
 		 516 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  29.4 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  28.73 
 
 		 426 aa  114  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  27.54 
 
 		 404 aa  113  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  30.38 
 
 		 748 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  29.32 
 
 		 405 aa  112  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  29.52 
 
 		 408 aa  111  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  30.62 
 
 		 510 aa  111  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  41.1 
 
 		 485 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  31.18 
 
 		 637 aa  110  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  28.61 
 
 		 443 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  28.95 
 
 		 405 aa  108  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  32.87 
 
 		 567 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  32.02 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  28.07 
 
 		 403 aa  105  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  31.64 
 
 		 512 aa  104  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  30.88 
 
 		 521 aa  103  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  33.94 
 
 		 469 aa  98.6  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  36.42 
 
 		 546 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  26.3 
 
 		 434 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  36.65 
 
 		 561 aa  95.9  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  27.8 
 
 		 404 aa  95.9  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  27.73 
 
 		 474 aa  96.3  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  30.24 
 
 		 464 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 360 aa  94.4  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  28.88 
 
 		 310 aa  94.4  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  25.78 
 
 		 434 aa  94  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  25.78 
 
 		 434 aa  94  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 502 aa  92.4  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  27.34 
 
 		 424 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  27.63 
 
 		 410 aa  89.7  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  25.7 
 
 		 426 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  27.71 
 
 		 547 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  26.02 
 
 		 594 aa  87.4  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  26.1 
 
 		 436 aa  87  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  26.4 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  27.32 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  25.92 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  25.92 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  29.5 
 
 		 473 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  41.01 
 
 		 572 aa  83.2  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  31.78 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3610  hypothetical protein  38.57 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  31.14 
 
 		 442 aa  80.5  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  40.94 
 
 		 561 aa  80.9  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  26.87 
 
 		 555 aa  80.5  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  27.76 
 
 		 256 aa  79.7  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  30 
 
 		 480 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  39.37 
 
 		 577 aa  78.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  28.24 
 
 		 523 aa  78.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  25.31 
 
 		 475 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  27.18 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  25.18 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  29.72 
 
 		 480 aa  77  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  29.72 
 
 		 480 aa  77  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  36 
 
 		 743 aa  76.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  34.51 
 
 		 661 aa  76.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  28.57 
 
 		 511 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  28.57 
 
 		 488 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  38.1 
 
 		 553 aa  74.7  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  27.17 
 
 		 512 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  27.27 
 
 		 535 aa  74.3  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  40.18 
 
 		 620 aa  74.3  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  29.71 
 
 		 519 aa  74.3  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  38.6 
 
 		 494 aa  73.9  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  24.26 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  25.12 
 
 		 377 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  25.9 
 
 		 479 aa  73.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  25.12 
 
 		 377 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  26.88 
 
 		 566 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  25.27 
 
 		 426 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  30.91 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  25.79 
 
 		 550 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  37.29 
 
 		 709 aa  72  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  33.54 
 
 		 627 aa  68.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  34.42 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>