20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28240 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_28240  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  285  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0664  hypothetical protein  48.72 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0288472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4044  protein of unknown function DUF456  49.01 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0085  hypothetical protein  43.75 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.296406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0722  hypothetical protein  50.62 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0095  hypothetical protein  43.06 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0104  hypothetical protein  43.06 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16000  Protein of unknown function (DUF456)  45.64 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.148783  normal  0.0914905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0112  hypothetical protein  48.37 
 
 		 161 aa  102  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1686  protein of unknown function DUF456  42.86 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0737  hypothetical protein  45.52 
 
 		 161 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2960  hypothetical protein  49.03 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3993  hypothetical protein  39.07 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1532  hypothetical protein  50 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0624636  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3772  protein of unknown function DUF456  40.4 
 
 		 167 aa  87.8  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2540  protein of unknown function DUF456  50 
 
 		 164 aa  84.3  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.658317  normal  0.52211 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27270  Protein of unknown function (DUF456)  36.88 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.236002  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1497  hypothetical protein  41.41 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19890  hypothetical protein  36.17 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.649353  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4908  hypothetical protein  41.61 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.417496  decreased coverage  0.00174056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>