More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27940 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2989  Glycine hydroxymethyltransferase  78.45 
 
 		 440 aa  652    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11114  serine hydroxymethyltransferase  75.3 
 
 		 426 aa  644    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000666035  normal  0.472146 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2501  Glycine hydroxymethyltransferase  76.24 
 
 		 427 aa  660    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3130  Glycine hydroxymethyltransferase  73.54 
 
 		 432 aa  638    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0754  Glycine hydroxymethyltransferase  82.55 
 
 		 428 aa  715    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128225  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27940  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 430 aa  872    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04680  serine hydroxymethyltransferase  74.64 
 
 		 426 aa  653    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1189  serine hydroxymethyltransferase  79.38 
 
 		 432 aa  677    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000045975 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0694  serine hydroxymethyltransferase  85.12 
 
 		 429 aa  757    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1663  Glycine hydroxymethyltransferase  74.19 
 
 		 435 aa  664    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1115  serine hydroxymethyltransferase  79.76 
 
 		 435 aa  677    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234213  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3981  Glycine hydroxymethyltransferase  78.3 
 
 		 434 aa  631  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21370  serine hydroxymethyltransferase  74.7 
 
 		 422 aa  625  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.100651  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13350  serine hydroxymethyltransferase  74.03 
 
 		 423 aa  600  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2353  serine hydroxymethyltransferase  70.26 
 
 		 423 aa  587  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0383526  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10070  serine hydroxymethyltransferase  68.56 
 
 		 425 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.9411  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  69.69 
 
 		 434 aa  580  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0767  serine hydroxymethyltransferase  68.5 
 
 		 445 aa  579  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0424  Glycine hydroxymethyltransferase  68.88 
 
 		 422 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  69.14 
 
 		 420 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3596  Glycine hydroxymethyltransferase  72.3 
 
 		 447 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2884  Glycine hydroxymethyltransferase  67.22 
 
 		 442 aa  568  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3705  serine hydroxymethyltransferase  68.21 
 
 		 453 aa  558  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4629  Glycine hydroxymethyltransferase  66.04 
 
 		 430 aa  551  1e-156  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0657  Glycine hydroxymethyltransferase  67.85 
 
 		 452 aa  546  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18800  serine hydroxymethyltransferase  68.84 
 
 		 412 aa  547  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  64.05 
 
 		 474 aa  534  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5659  Glycine hydroxymethyltransferase  66.83 
 
 		 421 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 		 413 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 		 412 aa  478  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 418 aa  475  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 		 415 aa  476  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  54.95 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 		 411 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  55.66 
 
 		 412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  55.13 
 
 		 416 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 		 415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  55.66 
 
 		 412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  56.62 
 
 		 415 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  58.82 
 
 		 415 aa  465  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  54.72 
 
 		 412 aa  464  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 		 413 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  53.77 
 
 		 412 aa  461  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  56.67 
 
 		 416 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  54.27 
 
 		 420 aa  462  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  55.53 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  56.13 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  55.02 
 
 		 425 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  54.74 
 
 		 413 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 		 414 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 		 414 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  54.74 
 
 		 414 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  55.26 
 
 		 417 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  55.02 
 
 		 425 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  55.1 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 		 413 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 		 413 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  56.16 
 
 		 424 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  55.53 
 
 		 434 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  56.86 
 
 		 434 aa  460  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  56.12 
 
 		 413 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  58.03 
 
 		 414 aa  457  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  54.35 
 
 		 412 aa  456  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  55.15 
 
 		 415 aa  458  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  53.44 
 
 		 416 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  53.14 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  54.3 
 
 		 410 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  54.3 
 
 		 410 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 415 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  53.86 
 
 		 414 aa  455  1e-127  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  54.63 
 
 		 415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  53.48 
 
 		 423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  53.46 
 
 		 413 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  53.72 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  55.4 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  56.12 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  56.49 
 
 		 427 aa  451  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  53.72 
 
 		 431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  53.72 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  53.28 
 
 		 411 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  54.69 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  54.55 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  53.49 
 
 		 423 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  57 
 
 		 417 aa  450  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  53.04 
 
 		 411 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  53.49 
 
 		 423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  53.24 
 
 		 423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  53.79 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  53.18 
 
 		 422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1438  glycine hydroxymethyltransferase  54.12 
 
 		 421 aa  443  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  52.76 
 
 		 422 aa  442  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  54.46 
 
 		 440 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0740  serine hydroxymethyltransferase  54.67 
 
 		 424 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  53.41 
 
 		 438 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  54.52 
 
 		 417 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>