More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27800 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27800  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 		 301 aa  584  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0770  alpha/beta hydrolase fold protein  50.9 
 
 		 268 aa  232  6e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2020  alpha/beta hydrolase fold protein  44.31 
 
 		 216 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1540  putative hydrolase  36.13 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153847  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2192  alpha/beta hydrolase fold protein  36.4 
 
 		 248 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.00021747 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29430  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.08 
 
 		 246 aa  122  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0217971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3111  putative hydrolase  35.91 
 
 		 258 aa  116  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0656  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  37.7 
 
 		 241 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1557  hypothetical protein  33.48 
 
 		 241 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  34.14 
 
 		 265 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 256 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13190  lysophospholipase  32.54 
 
 		 262 aa  92.8  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0607698  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1525  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.91 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169593  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2105  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  29 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  32.57 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  37 
 
 		 271 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  33.66 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.36 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.71 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.15 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  35.64 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.86 
 
 		 262 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  26.15 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  26.15 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  21.82 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4021  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.655043  normal  0.26756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.48 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  27.89 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  21.62 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 		 264 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  27.1 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  32.22 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1270  alpha/beta hydrolase fold protein  24.24 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273364  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  21.51 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 364 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 		 265 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 264 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  30.12 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  37.08 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0478294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0177  Fis family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1208  Alpha/beta hydrolase  38.89 
 
 		 273 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  42.86 
 
 		 261 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0641  hypothetical protein  35.29 
 
 		 261 aa  53.1  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0033841  normal  0.0977111 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  26 
 
 		 257 aa  53.1  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 331 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2211  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 		 270 aa  52.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 		 257 aa  52.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 		 350 aa  52.8  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0768  alpha/beta hydrolase fold  39.78 
 
 		 272 aa  52.8  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  26.41 
 
 		 290 aa  52.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5558  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 227 aa  52.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>