47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27290 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  417  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  42.13 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  36.78 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  41.38 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  39.25 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  36.07 
 
 		 201 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  35.93 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.32 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  36.81 
 
 		 206 aa  85.5  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  33.53 
 
 		 193 aa  85.1  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  35.23 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  37.66 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.11 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  36.7 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  32.06 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  35.54 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  34.21 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  33.12 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  31.97 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  33.12 
 
 		 180 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.32 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  43.96 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  32.7 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  35.81 
 
 		 192 aa  62  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  28.93 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  44.74 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  27.95 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  28.89 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  42.47 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  33.53 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  36.92 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05590  hypothetical protein  29.09 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604639  normal  0.83451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  36.51 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 182 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 98 aa  45.1  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2815  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 169 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.897524  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0052  transcriptional regulator, ArsR family  30.26 
 
 		 92 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.135929  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0006  regulatory protein, ArsR  39.68 
 
 		 98 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 472 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>