124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26760 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  100 
 
 
140 aa  280  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  60.29 
 
 
138 aa  170  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  37.98 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  34.56 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  35.59 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  33.85 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  35.51 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  34.48 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  33.1 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  34.31 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  38.61 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  29.93 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  32.26 
 
 
185 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  32.82 
 
 
182 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  35.29 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  29.79 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  33.62 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  31.5 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  31.2 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  31.2 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  29.41 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  33.09 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  33.06 
 
 
185 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  33.06 
 
 
185 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  27.41 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  29.46 
 
 
186 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  30.99 
 
 
152 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  29.1 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  30.99 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  30 
 
 
181 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  30.22 
 
 
152 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  25.78 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  33.06 
 
 
185 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  33.06 
 
 
185 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  33.06 
 
 
185 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  31.75 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  33.06 
 
 
185 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  33.06 
 
 
185 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  33.06 
 
 
185 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  33.06 
 
 
185 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1107  protein of unknown function DUF1486  35.63 
 
 
163 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  31.68 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  31.34 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  25.97 
 
 
204 aa  57.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  29.23 
 
 
286 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  30.89 
 
 
180 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  31.93 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  26.95 
 
 
141 aa  57  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  38.36 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  26.95 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4917  hypothetical protein  32.88 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  30.7 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  30.7 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  31.52 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  29.06 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  30.7 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  29.57 
 
 
150 aa  53.9  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  28.68 
 
 
286 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  28.68 
 
 
286 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  29.32 
 
 
138 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1364  hypothetical protein  38.67 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  26.32 
 
 
179 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  26.32 
 
 
182 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  26.32 
 
 
179 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  26.61 
 
 
212 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  32.61 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  32.32 
 
 
173 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  36.49 
 
 
126 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7231  protein of unknown function DUF1486  27.19 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.390995  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0317  protein of unknown function DUF1486  31.75 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478711 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4924  hypothetical protein  32.61 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3746  hypothetical protein  24.19 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  28.95 
 
 
128 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  26.32 
 
 
179 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  28.95 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4437  hypothetical protein  30.77 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195339  normal  0.857866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5713  protein of unknown function DUF1486  30.95 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  29.2 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0474  hypothetical protein  26.61 
 
 
212 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  26.92 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  28.79 
 
 
284 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  24.81 
 
 
182 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  36.11 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3560  protein of unknown function DUF1486  31.52 
 
 
173 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4135  protein of unknown function DUF1486  28.45 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5449  hypothetical protein  32.33 
 
 
155 aa  47.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  25.69 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  25.69 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  32.71 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  24.81 
 
 
182 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0561  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1364  hypothetical protein  36.11 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  24.81 
 
 
179 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  30.85 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2641  hypothetical protein  37.74 
 
 
332 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.0276572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  25.58 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  30.22 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  26.09 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  24.81 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  24.81 
 
 
179 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>