215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26280 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26280  glycerate kinase  100 
 
 		 385 aa  736    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0355581 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2626  glycerate kinase  53.76 
 
 		 403 aa  293  3e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  51.11 
 
 		 379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  49.72 
 
 		 379 aa  279  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  47.84 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2863  glycerate kinase  52.85 
 
 		 382 aa  276  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.480993 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  47.57 
 
 		 388 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  45.14 
 
 		 408 aa  276  6e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  45.14 
 
 		 408 aa  276  6e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  47.57 
 
 		 388 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  47.57 
 
 		 388 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  44.56 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  45.12 
 
 		 381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  45.65 
 
 		 380 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  44.85 
 
 		 381 aa  272  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  44.83 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  44.83 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  44.83 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  44.85 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  41.94 
 
 		 380 aa  270  4e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  46.03 
 
 		 382 aa  268  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  46.44 
 
 		 381 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  44.33 
 
 		 381 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  44.03 
 
 		 381 aa  265  8e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  44.54 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  43.41 
 
 		 387 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  44.54 
 
 		 380 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  44.26 
 
 		 380 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  48.68 
 
 		 381 aa  262  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  46.81 
 
 		 379 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  46.9 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  44.26 
 
 		 380 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  44.26 
 
 		 380 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  48.28 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  45.36 
 
 		 380 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  46.15 
 
 		 379 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  45.83 
 
 		 380 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  47.23 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  45.6 
 
 		 381 aa  253  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  45.16 
 
 		 383 aa  252  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  47.21 
 
 		 384 aa  252  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  43.73 
 
 		 380 aa  252  8.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  45.89 
 
 		 379 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3519  Glycerate kinase  48.19 
 
 		 397 aa  252  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3291  Glycerate kinase  43.09 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000409322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  47.48 
 
 		 389 aa  249  8e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0579  glycerate kinase  45.63 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.513033  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  41.11 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  42.41 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  47.07 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  43.05 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  43.91 
 
 		 379 aa  246  4.9999999999999997e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  45.57 
 
 		 384 aa  246  6e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  43.44 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1926  glycerate kinase  41.22 
 
 		 371 aa  243  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  41.92 
 
 		 395 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  40.21 
 
 		 386 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  47.87 
 
 		 381 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  43.01 
 
 		 382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  43.17 
 
 		 378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  43.99 
 
 		 379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  43.01 
 
 		 382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  37.87 
 
 		 384 aa  242  7e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  43.17 
 
 		 378 aa  242  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  42.63 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  47.89 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  39.74 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  44.39 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  42.74 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  39.62 
 
 		 381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  42.74 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  39.74 
 
 		 373 aa  239  4e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  39.01 
 
 		 381 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  41.99 
 
 		 381 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  47.66 
 
 		 375 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  39.01 
 
 		 385 aa  239  8e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  38.79 
 
 		 381 aa  239  8e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  45.09 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  38.74 
 
 		 381 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  43.27 
 
 		 379 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  43.27 
 
 		 379 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  43.27 
 
 		 379 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  43.27 
 
 		 379 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2952  glycerate kinase  48.35 
 
 		 386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  39.01 
 
 		 381 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  40.26 
 
 		 383 aa  235  9e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  38.74 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  39.84 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  38.73 
 
 		 381 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  40.05 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  38.46 
 
 		 381 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  36 
 
 		 383 aa  230  4e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0348  glycerate kinase  38.99 
 
 		 378 aa  229  6e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  35.9 
 
 		 380 aa  229  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  35.9 
 
 		 380 aa  229  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  39.84 
 
 		 402 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5030  glycerate kinase  40.53 
 
 		 380 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  40.76 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  39.22 
 
 		 403 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5723  glycerate kinase  52.34 
 
 		 397 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>