More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25490 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_25490  MAF protein  100 
 
 
223 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.124397  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1013  maf protein  68.64 
 
 
232 aa  282  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.374037  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1035  maf protein  69.51 
 
 
221 aa  281  6.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.611513 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3911  maf protein  63 
 
 
223 aa  259  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.487608  normal  0.0561371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3504  maf protein  56.82 
 
 
203 aa  210  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1140  maf protein  54.63 
 
 
229 aa  209  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0846  maf protein  54.91 
 
 
218 aa  206  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21150  MAF protein  51.1 
 
 
235 aa  200  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0823  maf protein  54.46 
 
 
211 aa  197  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.017605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1272  maf protein  51.29 
 
 
228 aa  197  9e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08240  MAF protein  52.68 
 
 
226 aa  190  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1041  maf protein  52.04 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.407711  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1838  maf protein  50.91 
 
 
209 aa  181  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.244014  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2443  maf protein  51.57 
 
 
195 aa  180  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1318  maf protein  49.57 
 
 
216 aa  179  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7197  Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation-like protein  52.91 
 
 
257 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  0.0550333 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05870  Maf-like protein  51.35 
 
 
223 aa  178  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.538428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0851  maf protein  54.27 
 
 
226 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0794  maf protein  54.09 
 
 
240 aa  174  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0145497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0163  Maf-like protein  38.12 
 
 
204 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.74208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0788  maf protein  46.82 
 
 
199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.353227  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1128  Maf-like protein  42.53 
 
 
196 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4232  maf protein  54.05 
 
 
219 aa  169  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337108  normal  0.701882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4892  Maf-like protein  45.29 
 
 
195 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0836  Maf-like protein  43.24 
 
 
197 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0679365  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3574  Maf-like protein  38.91 
 
 
206 aa  167  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2532  Maf-like protein  38.91 
 
 
206 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4776  Maf-like protein  47.77 
 
 
209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.714834  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1674  Maf-like protein  49.11 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0095  maf protein  40.18 
 
 
197 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4366  maf protein  49.55 
 
 
202 aa  158  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13311  Maf-like protein  45.29 
 
 
222 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  55.47 
 
 
475 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12351  Maf-like protein  35.71 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0455202 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1609  Nucleotide-binding protein  50.36 
 
 
484 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08381  Maf-like protein  45.63 
 
 
186 aa  145  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0209  Maf-like protein  44.72 
 
 
208 aa  142  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1594  Maf-like protein  44.66 
 
 
211 aa  141  7e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.697875  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1328  Maf-like protein  45.05 
 
 
210 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1292  Maf-like protein  45.05 
 
 
210 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.981627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1309  Maf-like protein  45.05 
 
 
210 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114265 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05680  MAF protein  41.7 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6393  Maf-like protein  47.51 
 
 
206 aa  137  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0769  Maf-like protein  35.78 
 
 
211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.91985  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16091  Maf-like protein  34.86 
 
 
211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.257914  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0768  maf protein  44.39 
 
 
184 aa  135  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.120928 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1258  maf protein  34.29 
 
 
206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.349097  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13361  Maf-like protein  35.24 
 
 
203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.377788  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13261  Maf-like protein  34.39 
 
 
204 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0698999  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13511  Maf-like protein  34.6 
 
 
203 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467144  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0649  maf protein  35.29 
 
 
220 aa  107  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000733747  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1652  Maf-like protein  33.49 
 
 
197 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1405  maf protein  33.33 
 
 
193 aa  102  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000139135  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3674  maf protein  38.99 
 
 
197 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  36.76 
 
 
194 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1513  maf protein  34.76 
 
 
192 aa  96.3  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.914638  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1300  maf protein  28.7 
 
 
199 aa  95.5  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.620785  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  35.98 
 
 
207 aa  95.1  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  36.19 
 
 
197 aa  94.7  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  34.93 
 
 
186 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1933  maf protein  30.14 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.810739  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  35.38 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2348  maf protein  30.97 
 
 
203 aa  94  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000032601  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1542  maf protein  32.72 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000755022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0535  maf protein  37.5 
 
 
194 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.997587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  34.8 
 
 
192 aa  92.8  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  36.45 
 
 
191 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  35.09 
 
 
194 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  35.81 
 
 
207 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  34.91 
 
 
197 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05420  MAF protein  36.36 
 
 
212 aa  92  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.417777  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  33.96 
 
 
197 aa  92  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  37.07 
 
 
194 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  36.41 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  36.62 
 
 
194 aa  90.9  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  30.99 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0513  maf protein  32.11 
 
 
192 aa  90.5  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0115044  hitchhiker  0.0000000008482 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  31.46 
 
 
191 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  31.92 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  30.05 
 
 
191 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  36.95 
 
 
194 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  31.46 
 
 
191 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  31.46 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  34.91 
 
 
197 aa  90.5  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3171  Maf-like protein  34.91 
 
 
191 aa  90.5  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  30.99 
 
 
191 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  34.25 
 
 
197 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  31.34 
 
 
191 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  33.8 
 
 
197 aa  89  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  33.8 
 
 
197 aa  89  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  33.8 
 
 
197 aa  89  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  33.18 
 
 
203 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  29.11 
 
 
191 aa  89  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  33.8 
 
 
197 aa  89  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  33.8 
 
 
197 aa  89  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  30.05 
 
 
191 aa  89  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1532  Maf-like protein  36.76 
 
 
193 aa  89  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.2886e-35 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  35.75 
 
 
200 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  35.87 
 
 
194 aa  89  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  35.75 
 
 
200 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>