More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23790 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  220  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  89.29 
 
 
112 aa  197  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  87.39 
 
 
113 aa  189  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  182  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1163  nitrogen regulatory protein P-II  89.19 
 
 
113 aa  179  8.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  71.43 
 
 
112 aa  169  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  163  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  160  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  155  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  69.64 
 
 
112 aa  154  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1394  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  153  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00884752  decreased coverage  0.00366325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3148  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000232085  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3426  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  147  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000243696  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  147  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3268  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0681608  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
117 aa  143  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2491  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  142  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0578365  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  139  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1609  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  139  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0701644  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  139  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  139  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2231  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000261063 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  137  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.14 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
114 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  137  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  137  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  137  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
136 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  136  8.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  136  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  136  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  136  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  136  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  135  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.46 
 
 
112 aa  135  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  55.36 
 
 
112 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0850  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
113 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
115 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  54.46 
 
 
112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.14 
 
 
112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  134  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  134  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0421  nitrogen regulatory protein P-II  64.86 
 
 
113 aa  134  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.666216 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  134  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  134  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  56.25 
 
 
112 aa  134  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  134  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  134  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  134  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
121 aa  134  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  134  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  134  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
114 aa  133  6.0000000000000005e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  56.25 
 
 
112 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  133  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>