161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23760 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_23760  amidohydrolase, imidazolonepropionase  100 
 
 		 378 aa  722    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1469  amidohydrolase  69.17 
 
 		 362 aa  429  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1166  amidohydrolase  65.18 
 
 		 373 aa  413  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11020  amidohydrolase, imidazolonepropionase  52.91 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.161229  normal  0.0546284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1281  amidohydrolase  56.91 
 
 		 364 aa  363  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1397  amidohydrolase  56.82 
 
 		 359 aa  354  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  decreased coverage  0.00549847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  54.93 
 
 		 356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3462  amidohydrolase 3  54.75 
 
 		 365 aa  351  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12929  hypothetical protein  54.39 
 
 		 370 aa  344  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0687  normal  0.519945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2182  amidohydrolase  50.7 
 
 		 360 aa  332  5e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  0.931322 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0984  amidohydrolase  52.84 
 
 		 358 aa  328  9e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000713577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3262  amidohydrolase  51.24 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09960  amidohydrolase, imidazolonepropionase  52.75 
 
 		 388 aa  317  3e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0916327  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1960  amidohydrolase  50.68 
 
 		 368 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2006  amidohydrolase  50.68 
 
 		 368 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.722686 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2226  amidohydrolase  48.31 
 
 		 360 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000139869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1940  amidohydrolase  50.41 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1562  amidohydrolase 3  50.97 
 
 		 362 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  normal  0.0640888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2486  amidohydrolase  47.77 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445092  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09720  Pro-Hyp dipeptidase  52.23 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.885607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4010  amidohydrolase  51.23 
 
 		 361 aa  305  9.000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4181  amidohydrolase  47.56 
 
 		 362 aa  276  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1191  amidohydrolase  49.45 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1612  amidohydrolase  45.15 
 
 		 358 aa  266  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0569822  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1302  amidohydrolase  48.6 
 
 		 359 aa  264  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2082  amidohydrolase  47.38 
 
 		 357 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3142  amidohydrolase  48.78 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000508689  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2244  amidohydrolase  46.39 
 
 		 367 aa  254  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.209508 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  28.85 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  26.79 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  25 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  27.22 
 
 		 433 aa  79.7  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  28.06 
 
 		 433 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  29.74 
 
 		 407 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  26.79 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3221  amidohydrolase  30.55 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000027233  hitchhiker  0.000156349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  27.6 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  28.09 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  30.93 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  29.73 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  29.23 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2674  amidohydrolase  34.77 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  31.98 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  31.98 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  31.98 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  25 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  28.57 
 
 		 426 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  28.03 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  27.02 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  26.06 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  30.48 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  25.89 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  28.24 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  32.58 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  24.85 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  27.9 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  25.38 
 
 		 437 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  24.16 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  25.63 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  27.08 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  29.56 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  28.42 
 
 		 433 aa  67  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  29.41 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  30.9 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  30.9 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  30.9 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1571  amidohydrolase  29.01 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0206923  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  25.15 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  26.11 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  28.32 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  34.48 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  28.88 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  33.82 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  24.27 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  24.86 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  25.32 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  23.69 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  27.09 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1522  amidohydrolase  29.45 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0533658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  27.84 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2402  amidohydrolase  28.13 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  26.89 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  26.96 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  29.08 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  23.44 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  33.13 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  29.5 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  26.57 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1966  amidohydrolase  31.74 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  26.27 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  24.17 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  24.81 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  26.64 
 
 		 455 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  26.01 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  25.18 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  26.89 
 
 		 391 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  29.24 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  29.24 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  29.24 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  25.19 
 
 		 702 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>