More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23570 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  100 
 
 
284 aa  540  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  69.4 
 
 
289 aa  376  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  63.57 
 
 
280 aa  276  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  59.72 
 
 
403 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  58.02 
 
 
302 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  52.35 
 
 
287 aa  238  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  46.52 
 
 
293 aa  223  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  46.74 
 
 
301 aa  222  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.09 
 
 
368 aa  222  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  47.08 
 
 
348 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  44.13 
 
 
292 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  48.86 
 
 
441 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  45.39 
 
 
339 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  42.42 
 
 
276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  48.48 
 
 
484 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 
292 aa  198  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  48.13 
 
 
290 aa  198  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  44.49 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  44.03 
 
 
313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  42.29 
 
 
311 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  42.03 
 
 
296 aa  192  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 
281 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  39.36 
 
 
284 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  39.36 
 
 
284 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  38.27 
 
 
322 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  39.36 
 
 
284 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  44.28 
 
 
281 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  43.91 
 
 
277 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  43.18 
 
 
308 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  37.1 
 
 
306 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  38.13 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  41.76 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  34.15 
 
 
306 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  39.5 
 
 
291 aa  161  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  38.49 
 
 
278 aa  153  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  33.12 
 
 
328 aa  146  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  33.22 
 
 
343 aa  140  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  42.31 
 
 
265 aa  112  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  41.54 
 
 
265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  34.07 
 
 
280 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  34.57 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  37.43 
 
 
286 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  42.13 
 
 
280 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  41.26 
 
 
267 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  40.56 
 
 
267 aa  105  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  35.2 
 
 
275 aa  105  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 
268 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 
272 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  35.71 
 
 
278 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  40.48 
 
 
282 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.97 
 
 
475 aa  104  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 
284 aa  103  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  38.22 
 
 
269 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  40.56 
 
 
267 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  33.72 
 
 
275 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  44.19 
 
 
290 aa  102  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  42.62 
 
 
277 aa  102  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  33.67 
 
 
285 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  41.06 
 
 
279 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  38.51 
 
 
341 aa  102  8e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  37.32 
 
 
342 aa  102  9e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  44.03 
 
 
282 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  44.36 
 
 
282 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1623  putative phosphatidate cytidylyltransferase  42.01 
 
 
288 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.942257  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  44.7 
 
 
285 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  44.03 
 
 
282 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  44.03 
 
 
282 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 
269 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  36.67 
 
 
260 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl286  CDP-diglyceride synthetase  38.57 
 
 
351 aa  100  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989718  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  31.63 
 
 
285 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  43.18 
 
 
281 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11011  phosphatidate cytidylyltransferase  47.9 
 
 
294 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.223077 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  38.69 
 
 
712 aa  101  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  47.46 
 
 
271 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  47.46 
 
 
271 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  41.4 
 
 
285 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  33.16 
 
 
285 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  41.4 
 
 
249 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.69 
 
 
307 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  35 
 
 
259 aa  99.8  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  41.4 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.4 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  41.4 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  41.4 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  41.4 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  41.4 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  41.4 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
282 aa  99.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  35.91 
 
 
260 aa  99.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2591  phosphatidate cytidylyltransferase  36.78 
 
 
301 aa  99  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.163491  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  41.4 
 
 
285 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.4 
 
 
285 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  41.4 
 
 
285 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  41.4 
 
 
285 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.4 
 
 
285 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  39.61 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 
254 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  51.75 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.367129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>