23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23340 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_23340  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  291  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863031  normal  0.0195601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1522  hypothetical protein  61.98 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1449  TPR repeat-containing protein  50.74 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262816  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1451  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.89 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000199447 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14720  hypothetical protein  45.03 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2228  hypothetical protein  46.43 
 
 		 160 aa  116  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00165353  normal  0.456563 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1220  hypothetical protein  53.54 
 
 		 155 aa  113  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2471  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  55.24 
 
 		 147 aa  113  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.514415  normal  0.576006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5820  hypothetical protein  43.45 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7873  hypothetical protein  40.56 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157939 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2375  tetratricopeptide TPR_2  43.36 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445663 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1028  hypothetical protein  46.4 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07130  hypothetical protein  52.94 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183807  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2173  hypothetical protein  38.1 
 
 		 169 aa  96.7  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142438  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4012  TPR repeat-containing protein  40.56 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678483  decreased coverage  0.00532252 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12785  transmembrane protein  40.27 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2108  tetratricopeptide TPR_2  37.88 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2154  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.289892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2091  TPR repeat-containing protein  37.12 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.100902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3552  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.497079  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1757  hypothetical protein  42.7 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1469  conserved hypothetical secreted protein  38.46 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.22177 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10410  hypothetical protein  33.93 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0104588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>