More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22290 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_22290  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
314 aa  628  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.586584  normal  0.554108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  77.88 
 
 
330 aa  489  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1331  ornithine carbamoyltransferase  77.27 
 
 
310 aa  473  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0593865  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1645  ornithine carbamoyltransferase  75.4 
 
 
310 aa  465  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  68.61 
 
 
310 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0812  ornithine carbamoyltransferase  64.94 
 
 
321 aa  418  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  66.34 
 
 
315 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  66.34 
 
 
327 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3157  ornithine carbamoyltransferase  68.83 
 
 
306 aa  401  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  65.9 
 
 
311 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  63.84 
 
 
338 aa  397  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  66.56 
 
 
308 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  64.97 
 
 
322 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2472  ornithine carbamoyltransferase  66.34 
 
 
306 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  63.4 
 
 
323 aa  391  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10130  ornithine carbamoyltransferase  60.71 
 
 
308 aa  375  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3024  ornithine carbamoyltransferase  65.5 
 
 
314 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  60.39 
 
 
307 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1500  ornithine carbamoyltransferase  60.7 
 
 
335 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  60.39 
 
 
307 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14380  ornithine carbamoyltransferase  64.61 
 
 
319 aa  370  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  62.01 
 
 
307 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  59.74 
 
 
307 aa  367  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1501  ornithine carbamoyltransferase  61.66 
 
 
333 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  57.61 
 
 
307 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  59.8 
 
 
309 aa  363  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  60.19 
 
 
310 aa  363  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  59.81 
 
 
312 aa  357  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  57.52 
 
 
307 aa  355  7.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1892  ornithine carbamoyltransferase  62.3 
 
 
321 aa  350  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  57.61 
 
 
307 aa  349  3e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  55.31 
 
 
312 aa  344  8.999999999999999e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  54.69 
 
 
340 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  54.75 
 
 
312 aa  305  7e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3066  ornithine carbamoyltransferase  56.72 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478337  normal  0.328556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  53.82 
 
 
317 aa  298  7e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
311 aa  296  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
311 aa  296  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  51.44 
 
 
309 aa  294  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
315 aa  294  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  50.48 
 
 
309 aa  291  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  47.25 
 
 
307 aa  285  7e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  46.93 
 
 
338 aa  280  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  46.28 
 
 
305 aa  278  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 
313 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  44.48 
 
 
304 aa  275  6e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  48.57 
 
 
313 aa  275  9e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  47.04 
 
 
355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  48.72 
 
 
306 aa  272  4.0000000000000004e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  47.16 
 
 
323 aa  272  6e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 
298 aa  272  7e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  46.96 
 
 
306 aa  271  9e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  44.12 
 
 
316 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  44.12 
 
 
316 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  46.58 
 
 
305 aa  271  1e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  44.44 
 
 
316 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  47.16 
 
 
309 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  44.12 
 
 
316 aa  270  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  46.08 
 
 
308 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  43.14 
 
 
316 aa  269  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  43.46 
 
 
316 aa  269  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  43.46 
 
 
316 aa  269  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  45.78 
 
 
314 aa  269  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  43.79 
 
 
316 aa  269  5e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  50.71 
 
 
313 aa  268  7e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  44.12 
 
 
316 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  49.64 
 
 
312 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  43.14 
 
 
316 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  46.43 
 
 
312 aa  265  5.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  44.34 
 
 
305 aa  265  5.999999999999999e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  50.36 
 
 
303 aa  265  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  50.9 
 
 
309 aa  265  7e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  51.09 
 
 
305 aa  265  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  44.22 
 
 
320 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  46.1 
 
 
312 aa  265  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  46.03 
 
 
329 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  46.43 
 
 
305 aa  264  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  47.3 
 
 
331 aa  263  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 
312 aa  264  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  43.14 
 
 
316 aa  263  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  45.75 
 
 
306 aa  263  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  45.83 
 
 
309 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  50.36 
 
 
304 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  50.72 
 
 
304 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  45.51 
 
 
312 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  45.45 
 
 
309 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  48.21 
 
 
318 aa  262  6e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  45.34 
 
 
303 aa  262  6.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  44.44 
 
 
308 aa  261  6.999999999999999e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  50.37 
 
 
309 aa  261  8e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  49.82 
 
 
312 aa  261  8e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  45.89 
 
 
312 aa  261  8e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  45.51 
 
 
309 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  43.04 
 
 
309 aa  260  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  42.81 
 
 
304 aa  260  2e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0666  ornithine carbamoyltransferase  48.74 
 
 
308 aa  261  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  45.13 
 
 
310 aa  259  3e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  45.4 
 
 
320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  48.11 
 
 
309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>