47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22120 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  100 
 
 		 396 aa  778    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  74.75 
 
 		 399 aa  599  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  75.51 
 
 		 395 aa  571  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2354  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  72.49 
 
 		 407 aa  545  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  hitchhiker  0.00636665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1343  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  68.84 
 
 		 404 aa  511  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3146  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  67.5 
 
 		 407 aa  494  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0465351  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3024  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  63.17 
 
 		 404 aa  475  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.468462  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2172  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  63.03 
 
 		 413 aa  472  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000233107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6055  membrane protein  62.28 
 
 		 403 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  63.59 
 
 		 395 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2010  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  62.4 
 
 		 399 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  66.31 
 
 		 389 aa  464  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1905  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  64.64 
 
 		 392 aa  461  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.028315  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1914  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  65.23 
 
 		 392 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0967076  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5425  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  60.21 
 
 		 398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.519507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4436  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  61.79 
 
 		 396 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  53.98 
 
 		 373 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1088  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  51.72 
 
 		 373 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.626516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5437  putative membrane-anchored protein  52.11 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3083  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.93 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1614  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  52.63 
 
 		 375 aa  358  7e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4071  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  53.03 
 
 		 390 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154875  normal  0.112383 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06600  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  43.67 
 
 		 371 aa  348  6e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2042  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  48.3 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.978362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1391  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  53.05 
 
 		 372 aa  333  3e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.645709  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1452  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  52.94 
 
 		 390 aa  332  7.000000000000001e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  48.59 
 
 		 365 aa  330  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3285  hypothetical protein  50 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2961  hypothetical protein  47.96 
 
 		 394 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3504  hypothetical protein  47.68 
 
 		 394 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376057  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2946  hypothetical protein  47.68 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2990  hypothetical protein  47.68 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  68.35 
 
 		 239 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  41.64 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11712  hypothetical protein  45.96 
 
 		 393 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2379  hypothetical protein  49.55 
 
 		 399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1687  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  44.38 
 
 		 382 aa  302  7.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.677284  hitchhiker  0.00191184 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2825  membrane protein  47.77 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25440  uncharacterized membrane-anchored protein  51.64 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.498784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2483  hypothetical protein  43.42 
 
 		 394 aa  259  9e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2031  hypothetical protein  58.91 
 
 		 156 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1244  hypothetical protein  31.77 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.745581  normal  0.686905 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1028  hypothetical protein  26.35 
 
 		 238 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.273367  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0314  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1452  hypothetical protein  26.71 
 
 		 239 aa  47  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125155  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1600  hypothetical protein  29.53 
 
 		 238 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  40.91 
 
 		 223 aa  43.1  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>