More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21950 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  63.83 
 
 
465 aa  641    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  66.01 
 
 
465 aa  657    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  83.01 
 
 
476 aa  834    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  84.63 
 
 
483 aa  835    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  63.4 
 
 
465 aa  635    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  64.29 
 
 
465 aa  645    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  86.36 
 
 
470 aa  832    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  87.06 
 
 
470 aa  843    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  63.85 
 
 
465 aa  643    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  63.83 
 
 
465 aa  641    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  64.07 
 
 
465 aa  644    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  64.29 
 
 
465 aa  647    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  64.07 
 
 
465 aa  644    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  79.42 
 
 
490 aa  814    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  82.99 
 
 
480 aa  840    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  81.66 
 
 
470 aa  815    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  84.42 
 
 
470 aa  831    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  63.58 
 
 
465 aa  650    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  84.43 
 
 
470 aa  841    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  63.97 
 
 
472 aa  644    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  84.97 
 
 
487 aa  832    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  71.67 
 
 
499 aa  741    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  86.13 
 
 
478 aa  852    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  63.85 
 
 
465 aa  643    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  87.76 
 
 
479 aa  875    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2442  FeS assembly protein SufB  82.43 
 
 
477 aa  802    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0668958  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  64.13 
 
 
463 aa  640    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  83.73 
 
 
487 aa  833    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  91.7 
 
 
481 aa  920    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  89.63 
 
 
479 aa  907    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14620  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  84.99 
 
 
475 aa  825    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0927589  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  81.88 
 
 
470 aa  822    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  65.8 
 
 
465 aa  654    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  63.85 
 
 
465 aa  643    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  64.07 
 
 
465 aa  644    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  64.07 
 
 
465 aa  643    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  84.86 
 
 
470 aa  832    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  83.73 
 
 
487 aa  833    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  65.25 
 
 
471 aa  636    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  66.74 
 
 
470 aa  667    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  66.09 
 
 
473 aa  659    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  100 
 
 
482 aa  999    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  82.37 
 
 
482 aa  847    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  73.36 
 
 
552 aa  756    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  82.11 
 
 
476 aa  832    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  84.75 
 
 
487 aa  831    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  81.74 
 
 
479 aa  823    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  83.44 
 
 
470 aa  818    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  91.13 
 
 
485 aa  919    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  85.06 
 
 
472 aa  835    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  65.54 
 
 
471 aa  637    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  83.73 
 
 
487 aa  833    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  82.17 
 
 
479 aa  827    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  64.29 
 
 
465 aa  645    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  83.51 
 
 
485 aa  834    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  65.69 
 
 
466 aa  654    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  85.28 
 
 
481 aa  838    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  83.99 
 
 
481 aa  850    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  83.37 
 
 
470 aa  832    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  81.08 
 
 
485 aa  830    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  63.79 
 
 
477 aa  653    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  66.6 
 
 
469 aa  673    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  62.66 
 
 
471 aa  626  1e-178  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  61.56 
 
 
467 aa  624  1e-177  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  61.82 
 
 
466 aa  616  1e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  60.35 
 
 
472 aa  609  1e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  60.35 
 
 
472 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  59.7 
 
 
468 aa  601  1.0000000000000001e-171  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  58.21 
 
 
469 aa  597  1e-169  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  58.32 
 
 
469 aa  578  1e-164  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  58.12 
 
 
470 aa  578  1e-164  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1111  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  59.45 
 
 
462 aa  548  1e-155  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2034  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  57.17 
 
 
476 aa  543  1e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4169  FeS assembly protein SufB  54.2 
 
 
486 aa  528  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.274482  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  54.75 
 
 
470 aa  528  1e-149  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  53.62 
 
 
467 aa  522  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  54.79 
 
 
475 aa  511  1e-144  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  52.71 
 
 
471 aa  509  1e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  54.08 
 
 
476 aa  508  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  55.01 
 
 
475 aa  506  9.999999999999999e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  54.81 
 
 
476 aa  505  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0488  FeS assembly protein SufB  50.21 
 
 
478 aa  505  9.999999999999999e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.8001  normal  0.461804 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  54.59 
 
 
476 aa  505  9.999999999999999e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  51.81 
 
 
464 aa  502  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  52.04 
 
 
464 aa  503  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  48.77 
 
 
488 aa  495  1e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  53.01 
 
 
476 aa  494  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  51.94 
 
 
471 aa  487  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  51.24 
 
 
470 aa  488  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  49.2 
 
 
463 aa  480  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  48.06 
 
 
469 aa  473  1e-132  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  48.19 
 
 
471 aa  462  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  47.27 
 
 
469 aa  456  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  47.74 
 
 
472 aa  458  1e-127  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  46.94 
 
 
483 aa  452  1.0000000000000001e-126  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  47.62 
 
 
479 aa  450  1e-125  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12910  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  47.05 
 
 
472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11489  hypothetical protein  81.22 
 
 
846 aa  427  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000249036  normal  0.700584 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1206  FeS assembly protein SufB  46.08 
 
 
470 aa  409  1e-113  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0384919  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0424  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  42.52 
 
 
479 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.746607  normal  0.0638657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>