160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21840 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  400  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  42.25 
 
 		 231 aa  135  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  44.71 
 
 		 207 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  42.51 
 
 		 216 aa  124  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  44.51 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  37.04 
 
 		 197 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  45.27 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  36.95 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  45.03 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  40.36 
 
 		 202 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  40.36 
 
 		 202 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  40.36 
 
 		 202 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  39.38 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  37.95 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  37.63 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  39.18 
 
 		 194 aa  91.3  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  38.66 
 
 		 194 aa  89.7  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  34.34 
 
 		 179 aa  88.6  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  36.69 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  40.34 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20560  hypothetical protein  35.82 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  32.8 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  35.2 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  35.75 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  32.76 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  35.85 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  29.57 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  38.65 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  36.9 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  32.5 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  37.29 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  29.57 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  40.64 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  39.88 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  28.65 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  45.45 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  40.74 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  42.86 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  36 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  32.94 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  41.83 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  29.67 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  33.52 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  42.07 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  32.16 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  28.8 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3386  BioY protein  35.11 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.812512  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  28.89 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  39.29 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  31.52 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  38.67 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  32.26 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  33.16 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  31.18 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  29.57 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  40.14 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  33.52 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  28.57 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  28.57 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  28.73 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  35.95 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  41.46 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01740  hypothetical protein  43.07 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  29.66 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  35.79 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  41.46 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  36.11 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  40.37 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5454  BioY protein  34.15 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0263826  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  40.29 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  30.72 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  46.15 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  49.37 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  39.22 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  38.46 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  28.27 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  28.27 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  40.32 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  28.27 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  28.27 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  28.27 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  37.7 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  37.25 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  42.47 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  37.59 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  37.86 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  36.25 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  33.99 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  30.73 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  25.3 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  36.08 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  36.08 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  34.66 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  36.69 
 
 		 191 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  28.57 
 
 		 182 aa  62  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  42.73 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  37.78 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  33.52 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  32.43 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1274  BioY protein  38.58 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>