199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21440 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_21440  siderophore-interacting protein  100 
 
 
277 aa  554  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.522532  normal  0.530536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0112  Siderophore-interacting protein  69.82 
 
 
277 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3016  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  67.87 
 
 
275 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2932  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  60.43 
 
 
275 aa  340  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453632  hitchhiker  0.000505579 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0237  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  47.51 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1601  Siderophore-interacting protein  37.22 
 
 
265 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3137  cyclic nucleotide-binding protein  43.73 
 
 
267 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.180684  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1592  Siderophore-interacting protein  38.38 
 
 
259 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2762  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  36.49 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2566  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  37.29 
 
 
312 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  39.06 
 
 
284 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  35.77 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38220  hypothetical protein  33.44 
 
 
302 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3252  hypothetical protein  31.79 
 
 
302 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3731  Siderophore-interacting protein  31.81 
 
 
356 aa  136  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  33.46 
 
 
340 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3473  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.44 
 
 
305 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100108  hitchhiker  0.00465132 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3213  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.55 
 
 
325 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000110595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2998  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.55 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0124793  normal  0.0292007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1914  siderophore-interacting protein  33.56 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5549  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.99 
 
 
308 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438451  normal  0.147517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2401  Siderophore-interacting protein  34.83 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000149826  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2292  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.77 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636042  normal  0.986884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3931  siderophore-interacting protein  32.62 
 
 
346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  36.23 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3865  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  33.44 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1437  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.35 
 
 
315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3687  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  37.45 
 
 
289 aa  126  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443256  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4255  siderophore-interacting protein  33.59 
 
 
250 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0094  siderophore-interacting protein  34.63 
 
 
250 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0099  siderophore-interacting protein  34.63 
 
 
252 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3789  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  30.43 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.14 
 
 
279 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0096  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.24 
 
 
247 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4105  Siderophore-interacting protein  33.44 
 
 
327 aa  118  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779952  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  32.16 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0076  siderophore-interacting protein  33.46 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  37.31 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0924  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  30.27 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04680  siderophore-interacting protein  30.65 
 
 
331 aa  115  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2205  siderophore-interacting protein  38.16 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2309  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  36.64 
 
 
311 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0424  Siderophore-interacting protein  29.77 
 
 
321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.625757 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0628  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.67 
 
 
299 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  32.62 
 
 
625 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1159  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.77 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139634  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2101  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.8 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  31.5 
 
 
255 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  33.58 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2184  siderophore-interacting protein  29.41 
 
 
246 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  normal  0.170908 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1787  Siderophore-interacting protein  33.01 
 
 
325 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00316265  normal  0.123717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4137  siderophore-interacting protein  36.6 
 
 
281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  30.4 
 
 
281 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.33 
 
 
281 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  33.2 
 
 
267 aa  109  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  36.29 
 
 
278 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  32.05 
 
 
623 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17630  siderophore-interacting protein  30.38 
 
 
285 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.868687  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  34.47 
 
 
277 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  33.85 
 
 
348 aa  106  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  38.46 
 
 
290 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4183  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.85 
 
 
301 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35080  siderophore-interacting protein  36.54 
 
 
345 aa  105  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  30.74 
 
 
261 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4467  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.9 
 
 
301 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3532  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.35 
 
 
257 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0313  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.81 
 
 
270 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  30.16 
 
 
253 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32 
 
 
283 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  29.53 
 
 
253 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  32.95 
 
 
291 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1968  siderophore-interacting protein  34.87 
 
 
285 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.76 
 
 
252 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1988  FAD-binding 9, siderophore-interacting  34.17 
 
 
285 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2034  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  34.17 
 
 
285 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870658  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  34.47 
 
 
277 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0997  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  32.85 
 
 
210 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118529 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12909  mycobactin utilization protein viuB  36.73 
 
 
283 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000043443  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  31.64 
 
 
280 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  31.42 
 
 
279 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  29.13 
 
 
253 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  29.69 
 
 
289 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0096  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  30.47 
 
 
248 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0091  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  30.08 
 
 
250 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  31.93 
 
 
617 aa  99.8  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  27.37 
 
 
277 aa  99.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  30.08 
 
 
248 aa  99.8  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2366  Siderophore-interacting protein  31.91 
 
 
258 aa  99.8  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.277442  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  32.44 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5136  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.75 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509715  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  34.36 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0871  siderophore-interacting protein  28.04 
 
 
247 aa  97.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314795  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  33.2 
 
 
273 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  33.2 
 
 
273 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  33.2 
 
 
273 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.82 
 
 
283 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  31.25 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0918  Siderophore-interacting protein  34.75 
 
 
273 aa  95.9  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.72 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3395  vibriobactin utilization protein ViuB  30.26 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.472238 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>