39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21300 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21300  hypothetical protein  100 
 
 		 686 aa  1330    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00049361  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3809  hypothetical protein  55.54 
 
 		 676 aa  662    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502089  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2921  hypothetical protein  56.55 
 
 		 651 aa  612  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29050  hypothetical protein  49.05 
 
 		 677 aa  521  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3562  hypothetical protein  50.24 
 
 		 649 aa  512  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2681  hypothetical protein  45.48 
 
 		 678 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0942599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0132  hypothetical protein  41.38 
 
 		 632 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03430  hypothetical protein  44.13 
 
 		 741 aa  411  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0316683  normal  0.637464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6378  hypothetical protein  37.88 
 
 		 626 aa  298  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1593  hypothetical protein  40.55 
 
 		 637 aa  291  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1703  hypothetical protein  40.86 
 
 		 641 aa  289  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.57569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6719  hypothetical protein  39.07 
 
 		 663 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3435  hypothetical protein  25.67 
 
 		 605 aa  171  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.80619 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5330  hypothetical protein  33.62 
 
 		 616 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3902  Uncharacterized conserved protein UCP014753  28.64 
 
 		 632 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.079236  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3410  hypothetical protein  32.34 
 
 		 611 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36223  normal  0.559533 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5047  hypothetical protein  31.03 
 
 		 616 aa  153  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7340  hypothetical protein  31.74 
 
 		 615 aa  151  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57213  hypothetical conserved protein of unknown function  28.77 
 
 		 626 aa  149  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4337  hypothetical protein  34.2 
 
 		 618 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78015  hitchhiker  0.0000641887 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3580  hypothetical protein  34.71 
 
 		 617 aa  144  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4008  hypothetical protein  32.55 
 
 		 618 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02610  conserved hypothetical protein  28.65 
 
 		 654 aa  140  8.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3533  hypothetical protein  34.02 
 
 		 584 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.644832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0930  hypothetical protein  29.46 
 
 		 495 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0983  hypothetical protein  29.38 
 
 		 495 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3365  hypothetical protein  28.64 
 
 		 495 aa  127  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.854489 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05733  conserved hypothetical protein  32.35 
 
 		 518 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03992  conserved hypothetical protein  26.43 
 
 		 735 aa  112  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6822  hypothetical protein  30.75 
 
 		 418 aa  111  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0924507  normal  0.22054 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08424  conserved hypothetical protein  29.44 
 
 		 689 aa  110  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0202574  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07089  conserved hypothetical protein  26.18 
 
 		 699 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1470  hypothetical protein  29.23 
 
 		 419 aa  104  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4103  hypothetical protein  28.26 
 
 		 406 aa  100  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2279  hypothetical protein  31.23 
 
 		 406 aa  97.8  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.22671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3947  hypothetical protein  27.65 
 
 		 418 aa  92.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1295  hypothetical protein  29.59 
 
 		 411 aa  91.7  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.306909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2239  hypothetical protein  27.96 
 
 		 418 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0313142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1690  hypothetical protein  24.66 
 
 		 384 aa  86.3  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>