More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20690 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  83.86 
 
 		 478 aa  781    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1505  pyruvate kinase  76.55 
 
 		 478 aa  734    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.33251  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20690  pyruvate kinase  100 
 
 		 472 aa  937    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0604306  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2215  pyruvate kinase  76.65 
 
 		 474 aa  674    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1221  pyruvate kinase  80.72 
 
 		 472 aa  777    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.724591  normal  0.678636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  71.91 
 
 		 505 aa  660    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14930  pyruvate kinase  69.15 
 
 		 489 aa  612  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  67.45 
 
 		 496 aa  614  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  68.09 
 
 		 496 aa  608  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  64.54 
 
 		 476 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11020  pyruvate kinase  64.54 
 
 		 495 aa  581  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.887694  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  63.03 
 
 		 476 aa  579  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  62.76 
 
 		 487 aa  568  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  60.9 
 
 		 474 aa  566  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  62.9 
 
 		 477 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  61.78 
 
 		 476 aa  558  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  62.85 
 
 		 474 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  63.69 
 
 		 481 aa  560  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  62.55 
 
 		 471 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5699  pyruvate kinase  60.29 
 
 		 493 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  62.13 
 
 		 472 aa  551  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  61.97 
 
 		 482 aa  549  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  60.64 
 
 		 476 aa  549  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  61.1 
 
 		 474 aa  548  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  61.78 
 
 		 472 aa  546  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  60.21 
 
 		 477 aa  538  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  61.32 
 
 		 482 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  60 
 
 		 472 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  62.18 
 
 		 471 aa  538  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  60.21 
 
 		 472 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  60.21 
 
 		 472 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  60.21 
 
 		 472 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  59.79 
 
 		 472 aa  535  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11633  pyruvate kinase  58.72 
 
 		 472 aa  523  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  57.78 
 
 		 476 aa  519  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1678  pyruvate kinase  61.23 
 
 		 471 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0855403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12930  pyruvate kinase  59.62 
 
 		 470 aa  495  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.18078  normal  0.227064 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0607  pyruvate kinase  55.23 
 
 		 479 aa  496  1e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0741  pyruvate kinase  53.14 
 
 		 480 aa  484  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.580936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  47.06 
 
 		 584 aa  425  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  49.37 
 
 		 478 aa  415  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  49.16 
 
 		 479 aa  413  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  46.12 
 
 		 583 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  48.62 
 
 		 471 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  44.94 
 
 		 578 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  44 
 
 		 583 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  47.15 
 
 		 482 aa  398  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  48.41 
 
 		 474 aa  392  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  44.68 
 
 		 480 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  45.24 
 
 		 480 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  45.76 
 
 		 590 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  45.99 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  45.53 
 
 		 589 aa  388  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  46.92 
 
 		 474 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  44.17 
 
 		 583 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  45.42 
 
 		 586 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  45.15 
 
 		 480 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  45.96 
 
 		 594 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  45.19 
 
 		 587 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  46.5 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  46.67 
 
 		 491 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  45.01 
 
 		 592 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  44.79 
 
 		 582 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  47.05 
 
 		 474 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  45.01 
 
 		 592 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  44.12 
 
 		 580 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  41.74 
 
 		 478 aa  373  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  44.49 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1475  pyruvate kinase  44.04 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.0298859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  44.05 
 
 		 588 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1491  pyruvate kinase  44.04 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0197868  hitchhiker  0.00000000000000413859 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1511  pyruvate kinase  44.04 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00345195  hitchhiker  0.00000000277605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1793  pyruvate kinase  44.04 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000263395  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1964  pyruvate kinase  44.04 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000120282  hitchhiker  0.00000000245997 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  42.35 
 
 		 590 aa  373  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  43.8 
 
 		 587 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  43.27 
 
 		 585 aa  375  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  44.44 
 
 		 479 aa  375  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01645  pyruvate kinase  43.07 
 
 		 470 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000322143  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1966  pyruvate kinase  43.07 
 
 		 470 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000099684  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4367  pyruvate kinase  44.81 
 
 		 489 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  43.06 
 
 		 585 aa  372  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1955  pyruvate kinase  43.07 
 
 		 470 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000401811  unclonable  0.000000014136 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1664  pyruvate kinase  41.7 
 
 		 469 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000486614  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1877  pyruvate kinase  43.07 
 
 		 470 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180077  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  44.07 
 
 		 600 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1892  pyruvate kinase  43.07 
 
 		 470 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4234  pyruvate kinase  46.51 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  42.65 
 
 		 585 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  372  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  42.86 
 
 		 585 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  43.06 
 
 		 585 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2390  pyruvate kinase  43.07 
 
 		 470 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000743671  hitchhiker  0.0000173681 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1520  pyruvate kinase  43.07 
 
 		 470 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000224591  decreased coverage  0.00000000336273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1757  pyruvate kinase  43.07 
 
 		 470 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.18747e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>