More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20390 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_20390  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  100 
 
 
550 aa  1040    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.209673  normal  0.62053 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  34.91 
 
 
578 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  35.04 
 
 
560 aa  258  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  36.09 
 
 
590 aa  256  6e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  33.46 
 
 
568 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  33.46 
 
 
568 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  33.27 
 
 
568 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  32.65 
 
 
574 aa  253  5.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  34.15 
 
 
573 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  33.39 
 
 
576 aa  250  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  31.23 
 
 
569 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  31.23 
 
 
569 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  31.66 
 
 
565 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  32.84 
 
 
575 aa  246  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  33.27 
 
 
583 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  33.33 
 
 
570 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  32.15 
 
 
573 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  33.15 
 
 
570 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  29.55 
 
 
567 aa  241  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  33.27 
 
 
600 aa  240  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  35.08 
 
 
571 aa  239  6.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  32.68 
 
 
585 aa  239  9e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  37.69 
 
 
569 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  37.79 
 
 
556 aa  238  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  32.04 
 
 
586 aa  236  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  33.15 
 
 
595 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  30.93 
 
 
576 aa  236  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  31.75 
 
 
579 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  32.59 
 
 
570 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  32.68 
 
 
585 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  32.75 
 
 
585 aa  233  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  31.38 
 
 
575 aa  233  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  32.55 
 
 
590 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  35.04 
 
 
592 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  32.77 
 
 
580 aa  231  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2521  sulphate transporter  33.58 
 
 
570 aa  231  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.062267 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  32.29 
 
 
585 aa  231  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  32.28 
 
 
567 aa  230  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  31.19 
 
 
591 aa  231  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  33.52 
 
 
582 aa  230  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  34.84 
 
 
605 aa  229  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  34.66 
 
 
590 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  33.87 
 
 
588 aa  227  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  31.91 
 
 
585 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  31.91 
 
 
585 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  31.91 
 
 
585 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  31.91 
 
 
585 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  33.46 
 
 
575 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  36.08 
 
 
610 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2014  sulfate permease family protein  32.88 
 
 
592 aa  223  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3088  sulfate permease family inorganic anion transporter  36.08 
 
 
610 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447137  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  36.08 
 
 
610 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2051  sulphate transporter  30.28 
 
 
579 aa  223  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.78423  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  32.49 
 
 
592 aa  223  8e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1943  sulfate permease family protein  30.28 
 
 
579 aa  223  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331101  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2031  sulfate permease family protein  35.78 
 
 
610 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1055  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.78 
 
 
610 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516115  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2321  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.78 
 
 
610 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.986632  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1341  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.78 
 
 
610 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0095  sulphate transporter  35.36 
 
 
550 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.618009  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5881  sulphate transporter  30.83 
 
 
570 aa  221  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  31.65 
 
 
596 aa  221  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1268  sulphate transporter  32.78 
 
 
658 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0855544  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2042  sulphate transporter  30.62 
 
 
578 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.875705  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  32.58 
 
 
584 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  31.41 
 
 
585 aa  220  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3841  sulphate transporter  34.49 
 
 
583 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.0852274 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2077  sulfate transporter  31.18 
 
 
565 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2518  sulfate transporter  30.24 
 
 
566 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.440075  normal  0.566321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5729  sulphate transporter  33.33 
 
 
572 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.46333 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4576  sulphate transporter  33.33 
 
 
572 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  33.03 
 
 
572 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2980  sulphate transporter  33.27 
 
 
558 aa  211  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3792  sulphate transporter  33.33 
 
 
619 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  34.51 
 
 
591 aa  209  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  31.32 
 
 
563 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  29.8 
 
 
588 aa  207  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  36.79 
 
 
573 aa  207  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  34.06 
 
 
558 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  30.47 
 
 
576 aa  204  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  31.02 
 
 
592 aa  201  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1066  sulphate transporter  32.07 
 
 
576 aa  200  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  32.05 
 
 
584 aa  200  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1029  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.94 
 
 
570 aa  200  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141667  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1270  sulfate permease family protein  33.94 
 
 
570 aa  200  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.333072  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0137  sulfate permease family protein  33.94 
 
 
570 aa  200  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1789  sulfate permease family protein  33.94 
 
 
570 aa  200  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.380427  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1758  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.94 
 
 
570 aa  200  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125807  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1810  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.94 
 
 
570 aa  200  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2524  sulfate permease family protein  33.74 
 
 
570 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1962  sulfate permease family protein  33.94 
 
 
570 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0829811  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4477  sulphate transporter  32.09 
 
 
624 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.496082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  30.76 
 
 
585 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1878  sulphate transporter  31.76 
 
 
572 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.536686  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  33.64 
 
 
587 aa  197  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  24.96 
 
 
574 aa  196  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2758  sulphate transporter  33.21 
 
 
574 aa  196  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  34.66 
 
 
572 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  26.21 
 
 
571 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  32.14 
 
 
569 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>