More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20380 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  100 
 
 
184 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4636  GCN5-related N-acetyltransferase  47.22 
 
 
166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4337  GCN5-related N-acetyltransferase  40.65 
 
 
168 aa  112  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.473125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2927  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 
310 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09031  transcriptional regulator, MarR family protein  33.57 
 
 
151 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.151689  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2571  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  38.62 
 
 
314 aa  102  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.808395  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  43.09 
 
 
324 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6080  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.31 
 
 
319 aa  99.4  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.11 
 
 
316 aa  95.9  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0834  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.06 
 
 
318 aa  93.6  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0786078  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  35.17 
 
 
160 aa  94  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
345 aa  92.8  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
327 aa  88.6  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  41.9 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2923  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00551848  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  35.21 
 
 
380 aa  69.3  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1928  GCN5-related N-acetyltransferase  35.51 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5915  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  39.76 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3661  GCN5-related N-acetyltransferase  44.32 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  33.66 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  37.62 
 
 
168 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4772  GCN5-related N-acetyltransferase  37.59 
 
 
166 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.000161675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.65 
 
 
311 aa  63.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 
167 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.82 
 
 
294 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00969  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01380)  28 
 
 
238 aa  62.8  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1365  putative acetyltransferase  38.24 
 
 
165 aa  62.4  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4712  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 
166 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 
166 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733249  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 
167 aa  61.6  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 
158 aa  61.6  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001152  histone acetyltransferase HPA2  38.24 
 
 
151 aa  61.6  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000449309  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
153 aa  61.6  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  22.94 
 
 
160 aa  61.2  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.62 
 
 
291 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  30.95 
 
 
387 aa  60.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  35.11 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3354  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3870  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 
154 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.47616 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
322 aa  60.5  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.43 
 
 
291 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4496  GCN5-related N-acetyltransferase  32.1 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000087115  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4320  GCN5-related N-acetyltransferase  39.73 
 
 
151 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.433453  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2461  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
314 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  33.01 
 
 
163 aa  59.7  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0460  putative acetyltransferase  37.14 
 
 
157 aa  59.3  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
352 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
172 aa  58.9  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  27.88 
 
 
306 aa  58.9  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  42.62 
 
 
167 aa  58.9  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0451  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  36.3 
 
 
295 aa  58.9  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.237261  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
320 aa  58.9  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  32.33 
 
 
290 aa  58.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  36.45 
 
 
167 aa  58.5  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  37.35 
 
 
170 aa  58.5  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  31.03 
 
 
167 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  31.03 
 
 
167 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  31.03 
 
 
167 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.5 
 
 
326 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  31.03 
 
 
167 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  43.24 
 
 
156 aa  57.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0377  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
162 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294177  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  43.06 
 
 
312 aa  57.8  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
349 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  42.86 
 
 
167 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  42.62 
 
 
167 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  42.62 
 
 
167 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  42.62 
 
 
167 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  42.62 
 
 
167 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1839  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.804646  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  42.62 
 
 
167 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  42.62 
 
 
167 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  42.62 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
347 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  42.62 
 
 
167 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1757  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06630  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  38.78 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300608  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 
196 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1075  acetyltransferase  30.61 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.353935  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
291 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.82 
 
 
349 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1496  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2003  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.071981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3907  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.586477  normal  0.215987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
171 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  39.51 
 
 
171 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
157 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  32.71 
 
 
189 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
171 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2857  YvbK  26.79 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640818  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  33.03 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1709  GCN5-related N-acetyltransferase  38.54 
 
 
165 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.674932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1632  acetyltransferase, GNAT family  27.78 
 
 
155 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00321176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>