More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20360 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 410 aa  757    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  55.32 
 
 		 402 aa  317  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  40.31 
 
 		 397 aa  243  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  39.55 
 
 		 406 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  41.04 
 
 		 392 aa  229  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  45.97 
 
 		 403 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  43.11 
 
 		 402 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  43.33 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 		 412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 735 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 		 422 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  37.32 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  34.72 
 
 		 408 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 408 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  38.18 
 
 		 409 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 404 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  34.73 
 
 		 401 aa  183  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 401 aa  182  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  36.92 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 398 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  38.92 
 
 		 394 aa  180  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  35.03 
 
 		 402 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  33.96 
 
 		 408 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 400 aa  176  8e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  33.33 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  33.43 
 
 		 451 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  33.43 
 
 		 451 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  33.43 
 
 		 451 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  33.15 
 
 		 451 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 412 aa  173  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  33.15 
 
 		 451 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  33.43 
 
 		 394 aa  173  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 404 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 403 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 403 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 		 416 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 408 aa  169  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 		 387 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 410 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 402 aa  166  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 401 aa  166  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 		 397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 410 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  34.24 
 
 		 395 aa  162  9e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 402 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 400 aa  159  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 394 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 420 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 399 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  31.9 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 413 aa  153  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 408 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  28.85 
 
 		 419 aa  149  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  34.76 
 
 		 397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  33.51 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  33.42 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 396 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 384 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  29.13 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  31.98 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  29.26 
 
 		 396 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  32.66 
 
 		 376 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  28.98 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  28.74 
 
 		 398 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  28.8 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  28.98 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  28.98 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>