23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19400 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19400  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  787    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2001  hypothetical protein  66.05 
 
 		 394 aa  500  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2620  hypothetical protein  61.98 
 
 		 413 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3064  hypothetical protein  58.11 
 
 		 386 aa  420  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0823748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0963  hypothetical protein  55.53 
 
 		 382 aa  415  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2261  hypothetical protein  47.62 
 
 		 394 aa  324  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6201  hypothetical protein  46.37 
 
 		 384 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0370  hypothetical protein  42.38 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0173  lipolytic protein G-D-S-L family  29.13 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8161  lipolytic protein G-D-S-L family  29.18 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6240  GDSL family lipase  28.63 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0092  lipolytic protein G-D-S-L family  27.27 
 
 		 338 aa  62.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1005  hypothetical protein  27.96 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1504  hypothetical protein  27.66 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.232931  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  23.27 
 
 		 593 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1387  hypothetical protein  20.13 
 
 		 358 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2781  hypothetical protein  31.3 
 
 		 341 aa  47  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0450  lipolytic protein G-D-S-L family  29.32 
 
 		 362 aa  46.6  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2366  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  29.13 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00890776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  23.88 
 
 		 593 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3572  hypothetical protein  23.31 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0629416  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2940  hypothetical protein  23.81 
 
 		 368 aa  43.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224706  normal  0.459011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  31.01 
 
 		 275 aa  42.7  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>