209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19140 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  100 
 
 		 530 aa  1060    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  50.36 
 
 		 551 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  47.98 
 
 		 499 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  44.65 
 
 		 580 aa  391  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  43.54 
 
 		 584 aa  388  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  45.47 
 
 		 580 aa  385  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  49.26 
 
 		 535 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  44.88 
 
 		 558 aa  372  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  62.65 
 
 		 628 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  36.8 
 
 		 556 aa  219  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  33.57 
 
 		 585 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  36.05 
 
 		 507 aa  206  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  37.68 
 
 		 603 aa  204  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  37.3 
 
 		 566 aa  203  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  36.54 
 
 		 602 aa  200  6e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  35.47 
 
 		 568 aa  197  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  32.7 
 
 		 620 aa  183  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  52.3 
 
 		 714 aa  174  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  45.83 
 
 		 605 aa  162  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  33.89 
 
 		 748 aa  136  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  42.53 
 
 		 508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  31.34 
 
 		 567 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  30.57 
 
 		 516 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  29.19 
 
 		 567 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  30.35 
 
 		 484 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  43.15 
 
 		 222 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  29.35 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  31.44 
 
 		 637 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  42.57 
 
 		 443 aa  104  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  41.22 
 
 		 443 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  41.84 
 
 		 485 aa  99  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  28.3 
 
 		 481 aa  96.3  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  39.44 
 
 		 469 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  26.17 
 
 		 512 aa  95.1  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  36.11 
 
 		 510 aa  94  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  47.37 
 
 		 310 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  35.1 
 
 		 561 aa  91.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  32.24 
 
 		 546 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  43.65 
 
 		 521 aa  89.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  26.91 
 
 		 539 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  27.61 
 
 		 502 aa  89.4  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  26.1 
 
 		 594 aa  87.4  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 360 aa  87  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  25.77 
 
 		 464 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  26.29 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  33 
 
 		 519 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  27.65 
 
 		 550 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  39.68 
 
 		 561 aa  81.6  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  35.81 
 
 		 661 aa  81.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  39.04 
 
 		 535 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  37.93 
 
 		 572 aa  81.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  45.1 
 
 		 581 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  25.2 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  45.1 
 
 		 581 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  39.68 
 
 		 577 aa  80.5  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  30.45 
 
 		 517 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  27.5 
 
 		 498 aa  79.7  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  45.1 
 
 		 578 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  42.16 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  42.16 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  35.97 
 
 		 198 aa  79  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  42.16 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  34.95 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  33.75 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  30.77 
 
 		 524 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  44.12 
 
 		 578 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  44.12 
 
 		 593 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  44.12 
 
 		 593 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  24.93 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  24.93 
 
 		 547 aa  77.4  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  35.33 
 
 		 709 aa  77  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  38.68 
 
 		 512 aa  77  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  43.14 
 
 		 578 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  24.93 
 
 		 404 aa  76.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  43.14 
 
 		 578 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  37.01 
 
 		 743 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  46.32 
 
 		 550 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  35.66 
 
 		 169 aa  75.1  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  28.15 
 
 		 516 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  45.26 
 
 		 519 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 620 aa  74.7  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  33.76 
 
 		 519 aa  74.3  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  24.87 
 
 		 488 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 535 aa  73.6  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  25.19 
 
 		 511 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  32.77 
 
 		 423 aa  73.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  36.2 
 
 		 413 aa  73.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  24.13 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  34.12 
 
 		 407 aa  72  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  30.81 
 
 		 553 aa  72  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  34.53 
 
 		 566 aa  71.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  42.72 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  42.72 
 
 		 508 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  42.72 
 
 		 508 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  41.75 
 
 		 508 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  41.75 
 
 		 508 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  42.72 
 
 		 491 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  42.72 
 
 		 491 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  42.72 
 
 		 516 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>