90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18900 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18900  predicted naringenin-chalcone synthase  100 
 
 		 396 aa  777    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0312297  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04550  predicted naringenin-chalcone synthase  55.18 
 
 		 382 aa  413  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2198  naringenin-chalcone synthase  57.18 
 
 		 404 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1939  Naringenin-chalcone synthase  57.14 
 
 		 399 aa  398  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000153142 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2809  Naringenin-chalcone synthase  57.58 
 
 		 413 aa  381  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2532  chalcone and stilbene synthase domain protein  39.33 
 
 		 404 aa  244  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0466  chalcone and stilbene synthase domain protein  36.01 
 
 		 373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0256  naringenin-chalcone synthase  35.48 
 
 		 362 aa  232  8.000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.524336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2037  Naringenin-chalcone synthase  35.14 
 
 		 656 aa  220  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629301  normal  0.879643 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1339  naringenin-chalcone synthase  38.5 
 
 		 363 aa  219  8.999999999999998e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.538359  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0421  chalcone synthase  34.86 
 
 		 362 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4712  naringenin-chalcone synthase  43.92 
 
 		 357 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3794  naringenin-chalcone synthase  34.02 
 
 		 362 aa  216  7e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18741  chalcone synthase (CHS)  38.65 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.406295 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3391  Naringenin-chalcone synthase  41.55 
 
 		 360 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4396  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  38.68 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4821  chalcone and stilbene synthase domain protein  37.05 
 
 		 344 aa  176  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2326  chalcone and stilbene synthase domain protein  37.66 
 
 		 393 aa  172  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1186  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  44.11 
 
 		 376 aa  169  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.857577  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0145  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  36.44 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20410  predicted naringenin-chalcone synthase  42.95 
 
 		 351 aa  159  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4264  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  39.5 
 
 		 368 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.188151 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4694  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  40.19 
 
 		 349 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5033  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.21 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.952361  normal  0.260327 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11401  hypothetical protein  30.63 
 
 		 393 aa  142  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3232  chalcone and stilbene synthase domain protein  29.02 
 
 		 363 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3899  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.98 
 
 		 406 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.824254  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1740  chalcone and stilbene synthase domain protein  29.27 
 
 		 377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1028  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.17 
 
 		 349 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0021  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  34.46 
 
 		 354 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1903  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  30.36 
 
 		 350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000467282 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3897  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  34.32 
 
 		 406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29550  Type III polyketide synthase  34.69 
 
 		 406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.96869  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0398  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  32.49 
 
 		 350 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2104  chalcone and stilbene synthase domain protein  32.78 
 
 		 361 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1160  chalcone and stilbene synthase domain protein  40 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.640364  hitchhiker  0.0041842 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2112  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  33.33 
 
 		 361 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.454766  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0430  chalcone and stilbene synthase domain protein  32.07 
 
 		 350 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1888  chalcone and stilbene synthase domain protein  34.9 
 
 		 370 aa  129  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3187  chalcone and stilbene synthase domain protein  26.55 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.397507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10908  naringenin-chalcone synthase  25.69 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.559133  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29530  Type III polyketide synthase  32.78 
 
 		 409 aa  126  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4185  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  37.92 
 
 		 355 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0192422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0415  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  36.8 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5115  chalcone and stilbene synthase domain protein  33.79 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3635  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.9 
 
 		 344 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0416  chalcone and stilbene synthase domain protein  36.06 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0387  chalcone/stilbene synthase-like  36.56 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.363189  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1642  chalcone and stilbene synthase domain protein  26.63 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00774069 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3105  chalcone and stilbene synthases-like  31.97 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3808  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  24.23 
 
 		 350 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5140  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.67 
 
 		 360 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1949  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  36.73 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1059  chalcone and stilbene synthases-like protein  29.95 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1075  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.95 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0226  naringenin-chalcone synthase  31.33 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1086  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.69 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0962351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1868  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.07 
 
 		 349 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2390  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.87 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2458  chalcone and stilbene synthases-like  30.37 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2602  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  31.29 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3991  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  33.11 
 
 		 357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222559  normal  0.414224 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4105  chalcone and stilbene synthases-like  27.06 
 
 		 394 aa  113  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137291  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0202  putative Type III polyketide synthase  29.63 
 
 		 350 aa  113  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5949  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  35.27 
 
 		 352 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.0327105 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2676  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.07 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1084  chalcone and stilbene synthases-like protein  31.61 
 
 		 347 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4977  chalcone and stilbene synthase domain protein  33.21 
 
 		 365 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00500  predicted naringenin-chalcone synthase  31.61 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.281948  normal  0.904387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1196  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  28.64 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11683  chalcone synthase pks11  28.75 
 
 		 353 aa  106  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.133328  normal  0.163848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2733  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.52 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1684  chalcone and stilbene synthases-like protein  33.71 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.436758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2375  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.33 
 
 		 306 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2367  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980596  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2328  chalcone and stilbene synthases-like protein  29.33 
 
 		 306 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.579896  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5652  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.06 
 
 		 352 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11678  chalcone synthase pks10  26.55 
 
 		 353 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1099  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  22.43 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3101  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  29.87 
 
 		 330 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148941 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5065  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.61 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1850  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  29.24 
 
 		 330 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1613  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.96 
 
 		 328 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26714  beta ketoacyl-coa synthase  21.09 
 
 		 545 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3017  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.11 
 
 		 335 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1100  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.67 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3487  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  31.91 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0480976  normal  0.0154282 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2428  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  26.28 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000247729  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1974  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.18 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568575  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0068  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.34 
 
 		 329 aa  43.9  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>