More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18710 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 160 aa  321  3e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  54.67 
 
 		 163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  49.29 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  48.3 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1933  transcriptional regulator, MarR family  46.84 
 
 		 184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  51.39 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  36.59 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  35.92 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  31.45 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 165 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  36.7 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  33.09 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 193 aa  57.4  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 233 aa  57.4  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  31.47 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  33.93 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  36 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  35 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0180  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  36.89 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 128 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  37 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1986  transcriptional regulator, MarR family  40.23 
 
 		 161 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  hitchhiker  0.000536979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 159 aa  50.8  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 157 aa  50.8  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>