233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18640 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_18640  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.685754  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  57.35 
 
 
215 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  52.82 
 
 
214 aa  182  5.0000000000000004e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  51.3 
 
 
213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  49.25 
 
 
209 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  51.26 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  48.32 
 
 
211 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  48.32 
 
 
211 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  40.21 
 
 
212 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  48.32 
 
 
211 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  47.65 
 
 
211 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  47.65 
 
 
211 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  49.3 
 
 
211 aa  158  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  49.3 
 
 
211 aa  158  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  49.3 
 
 
211 aa  158  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  48.59 
 
 
211 aa  158  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  41.71 
 
 
211 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  47.89 
 
 
211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  44 
 
 
213 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  53.85 
 
 
212 aa  152  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  39.42 
 
 
214 aa  150  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  41.01 
 
 
225 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  50.85 
 
 
233 aa  146  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  39.09 
 
 
207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  36.46 
 
 
211 aa  145  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  37.24 
 
 
211 aa  142  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  56.41 
 
 
208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  44.44 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  47.62 
 
 
210 aa  132  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2068  hypothetical protein  48.99 
 
 
232 aa  131  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0096752  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  45.65 
 
 
210 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  44.97 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  36.36 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  41.94 
 
 
201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  45.1 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1716  hypothetical protein  48.37 
 
 
206 aa  126  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  34.38 
 
 
206 aa  126  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  40.46 
 
 
204 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  39.25 
 
 
206 aa  123  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1806  protein of unknown function UPF0029  55.7 
 
 
233 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000629698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  40.31 
 
 
204 aa  122  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  41.13 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  41.13 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  41.13 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  41.61 
 
 
213 aa  119  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  37.1 
 
 
207 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  41.08 
 
 
290 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  53.06 
 
 
206 aa  116  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  35.48 
 
 
207 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  32.29 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  39.01 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  41.67 
 
 
225 aa  115  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  41.38 
 
 
245 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  43.98 
 
 
194 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  37.57 
 
 
218 aa  115  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  39.8 
 
 
203 aa  114  8.999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3185  hypothetical protein  49.32 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0320756  hitchhiker  0.00000000052125 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  41.15 
 
 
213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  43.98 
 
 
194 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  37.13 
 
 
204 aa  113  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  42.66 
 
 
205 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  38.71 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  34.4 
 
 
195 aa  112  5e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  51.38 
 
 
205 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  44.91 
 
 
195 aa  112  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  41.67 
 
 
274 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  39.5 
 
 
239 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  40.11 
 
 
195 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  38.24 
 
 
206 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  37.23 
 
 
211 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  38.89 
 
 
194 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  36.41 
 
 
200 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  41.61 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  35 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  38.5 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  42.11 
 
 
195 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  42.11 
 
 
195 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0960  hypothetical protein  45.36 
 
 
219 aa  109  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239073  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  49.19 
 
 
222 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  42.11 
 
 
195 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  37.26 
 
 
216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  35.43 
 
 
198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  40.44 
 
 
204 aa  108  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  40 
 
 
195 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  37.56 
 
 
204 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  49.19 
 
 
197 aa  108  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  49.18 
 
 
218 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  38.92 
 
 
216 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  30.81 
 
 
203 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  39.72 
 
 
203 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  46.51 
 
 
199 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  49.19 
 
 
197 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  42.14 
 
 
210 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  29.41 
 
 
192 aa  106  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  34.44 
 
 
198 aa  106  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  37.64 
 
 
198 aa  106  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  32.84 
 
 
208 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  38.18 
 
 
211 aa  105  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  38 
 
 
203 aa  105  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  38.78 
 
 
242 aa  105  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>