28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18570 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18570  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  764    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.000320987  normal  0.0615594 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1784  hypothetical protein  63.4 
 
 		 388 aa  401  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000515707  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2056  protein of unknown function DUF952  64.34 
 
 		 502 aa  391  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0199379  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1827  hypothetical protein  60.51 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5863  hypothetical protein  57.66 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2433  hypothetical protein  56.93 
 
 		 353 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.657563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1772  hypothetical protein  63.02 
 
 		 334 aa  362  4e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1500  hypothetical protein  57.89 
 
 		 371 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.472105  hitchhiker  0.000928379 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1865  protein of unknown function DUF952  63.28 
 
 		 387 aa  355  5.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00749947  normal  0.185067 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1286  hypothetical protein  56.96 
 
 		 374 aa  354  1e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4457  hypothetical protein  53.63 
 
 		 373 aa  352  8e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375251  normal  0.0701737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2315  hypothetical protein  58.49 
 
 		 352 aa  348  6e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000142182  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2248  hypothetical protein  57.11 
 
 		 374 aa  346  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.147862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2366  hypothetical protein  56.53 
 
 		 361 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.646563  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1878  hypothetical protein  59.42 
 
 		 363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2685  hypothetical protein  54.03 
 
 		 353 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16050  hypothetical protein  47.5 
 
 		 371 aa  294  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0596  hypothetical protein  42.73 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1093  hypothetical protein  41.09 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0349862  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1323  hypothetical protein  48.37 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2047  hypothetical protein  40.95 
 
 		 360 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1285  hypothetical protein  44.51 
 
 		 367 aa  241  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.099522  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06820  hypothetical protein  38.08 
 
 		 364 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1551  hypothetical protein  34.83 
 
 		 358 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.804508  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1674  hypothetical protein  34.02 
 
 		 372 aa  179  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455144 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1341  hypothetical protein  29.5 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000130295  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1446  hypothetical protein  33.24 
 
 		 337 aa  122  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0376181  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3088  hypothetical protein  34.84 
 
 		 341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>