72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18250 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18250  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  843    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1737  protein of unknown function DUF881  51.93 
 
 		 383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.588526  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1887  protein of unknown function DUF881  49.79 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.201634 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1303  protein of unknown function DUF881  55.9 
 
 		 333 aa  212  9e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.412447  normal  0.898355 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2103  protein of unknown function DUF881  49.12 
 
 		 246 aa  204  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2384  hypothetical protein  41.13 
 
 		 305 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0799  hypothetical protein  34.6 
 
 		 278 aa  151  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2522  hypothetical protein  41.86 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0474  hypothetical protein  35.05 
 
 		 273 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.166474  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1228  hypothetical protein  34.04 
 
 		 271 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.861927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2728  protein of unknown function DUF881  39.45 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428607  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4012  protein of unknown function DUF881  39.13 
 
 		 255 aa  144  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033042  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3098  protein of unknown function DUF881  42.17 
 
 		 258 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4999  hypothetical protein  36.12 
 
 		 283 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3126  protein of unknown function DUF881  39.08 
 
 		 571 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2846  hypothetical protein  34.98 
 
 		 270 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2877  hypothetical protein  34.98 
 
 		 270 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2890  hypothetical protein  34.98 
 
 		 270 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11855  hypothetical protein  35.14 
 
 		 292 aa  123  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15510  hypothetical protein  33.6 
 
 		 250 aa  120  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1466  hypothetical protein  35.5 
 
 		 296 aa  114  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3404  hypothetical protein  32.04 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227023  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3137  hypothetical protein  32.2 
 
 		 254 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428458  normal  0.0440298 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2715  hypothetical protein  35.06 
 
 		 245 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0632611  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14990  hypothetical protein  36.96 
 
 		 248 aa  98.2  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  0.621189 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  30.18 
 
 		 234 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  30.47 
 
 		 239 aa  94.4  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  32.06 
 
 		 234 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2282  hypothetical protein  28.09 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0713183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  28.36 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  27.35 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  30.34 
 
 		 286 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  30.94 
 
 		 230 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  32.18 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  25.59 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  31.47 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2250  hypothetical protein  27.91 
 
 		 242 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  25.12 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000489323  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  24.75 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  28.57 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  25.29 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0014  protein of unknown function DUF881  27.9 
 
 		 257 aa  59.7  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  30.95 
 
 		 233 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  23.63 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  27.72 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  31.58 
 
 		 244 aa  57  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2105  protein of unknown function DUF881  31.61 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1305  protein of unknown function DUF881  31.72 
 
 		 286 aa  57  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.498875  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15490  hypothetical protein  31.2 
 
 		 315 aa  56.2  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00160  hypothetical protein  31.72 
 
 		 250 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2111  hypothetical protein  24.23 
 
 		 238 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0569  protein of unknown function DUF881  29.46 
 
 		 243 aa  51.2  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.787113  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1889  protein of unknown function DUF881  32.74 
 
 		 306 aa  50.1  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0814  hypothetical protein  26.7 
 
 		 253 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244335  normal  0.77774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3123  protein of unknown function DUF881  30.56 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  27.17 
 
 		 234 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  23.74 
 
 		 215 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27030  hypothetical protein  30 
 
 		 252 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99659  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0057  hypothetical protein  32.95 
 
 		 267 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.573043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0020  hypothetical protein  27.62 
 
 		 272 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.987463 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10012  hypothetical protein  30.38 
 
 		 262 aa  47  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18230  hypothetical protein  28.28 
 
 		 288 aa  47  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509539  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0015  hypothetical protein  37.29 
 
 		 263 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3100  protein of unknown function DUF881  34.02 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1230  hypothetical protein  27.97 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0052  hypothetical protein  31.82 
 
 		 309 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1825  hypothetical protein  22.68 
 
 		 238 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0612463  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0013  hypothetical protein  25.45 
 
 		 278 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.447564 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1735  protein of unknown function DUF881  24.71 
 
 		 290 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.980276  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0013  hypothetical protein  25.45 
 
 		 278 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0021  hypothetical protein  25.45 
 
 		 278 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1285  protein of unknown function DUF881  26.56 
 
 		 246 aa  43.5  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>