More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17960 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_17960  aspartate carbamoyltransferase  100 
 
 
349 aa  704    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1842  aspartate carbamoyltransferase  79.08 
 
 
351 aa  539  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.553475  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1325  aspartate carbamoyltransferase  77.11 
 
 
333 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.358229 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1708  aspartate carbamoyltransferase  77.42 
 
 
335 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3005  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  74.92 
 
 
323 aa  486  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  71.8 
 
 
332 aa  475  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.03 
 
 
328 aa  455  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2003  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  69.5 
 
 
342 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000182057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2266  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  69.91 
 
 
337 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.21 
 
 
323 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  69.82 
 
 
324 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14730  aspartate carbamoyltransferase  68.98 
 
 
320 aa  444  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.41124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  68.9 
 
 
311 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12620  aspartate carbamoyltransferase  68.55 
 
 
327 aa  437  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0895444  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  67.68 
 
 
313 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  69.3 
 
 
302 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  68.18 
 
 
309 aa  425  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  68.54 
 
 
310 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  68.39 
 
 
306 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.77 
 
 
313 aa  422  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  68.88 
 
 
312 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.27 
 
 
308 aa  420  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.96 
 
 
309 aa  418  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.87 
 
 
308 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.24 
 
 
318 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15550  aspartate carbamoyltransferase  61.08 
 
 
310 aa  368  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.51 
 
 
315 aa  358  7e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.68 
 
 
319 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  58.33 
 
 
316 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.61 
 
 
315 aa  352  8e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2404  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.98 
 
 
316 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2363  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.98 
 
 
316 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0607904  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2410  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.98 
 
 
316 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2585  aspartate carbamoyltransferase  56.6 
 
 
318 aa  344  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5245  aspartate carbamoyltransferase  59.94 
 
 
311 aa  344  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12660  aspartate carbamoyltransferase  56.55 
 
 
319 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0228481 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  53.68 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  53.17 
 
 
306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.82 
 
 
308 aa  309  5e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  51.22 
 
 
314 aa  306  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3200  aspartate carbamoyltransferase  51.98 
 
 
314 aa  306  4.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  52.62 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.75 
 
 
313 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.3 
 
 
307 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  51.06 
 
 
313 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  48.78 
 
 
311 aa  299  4e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  50.89 
 
 
320 aa  298  8e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.85 
 
 
318 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.4 
 
 
336 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0464  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.54 
 
 
317 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.958757  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.54 
 
 
346 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.8 
 
 
312 aa  297  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.34 
 
 
316 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1465  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.54 
 
 
343 aa  295  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981882  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2749  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.54 
 
 
361 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.54 
 
 
361 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3145  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.54 
 
 
361 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1994  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.54 
 
 
343 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165088  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.54 
 
 
361 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3167  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.54 
 
 
343 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3109  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.54 
 
 
361 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1581  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.15 
 
 
320 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.07 
 
 
316 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.94 
 
 
313 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  51.21 
 
 
329 aa  293  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  47.38 
 
 
312 aa  293  3e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.94 
 
 
313 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  49.55 
 
 
313 aa  293  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.31 
 
 
315 aa  293  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  50.91 
 
 
312 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.31 
 
 
328 aa  293  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.31 
 
 
315 aa  293  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1641  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.78 
 
 
321 aa  293  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.452041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.76 
 
 
334 aa  292  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.63 
 
 
313 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.8 
 
 
334 aa  291  8e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.686364  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.34 
 
 
311 aa  291  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2913  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.35 
 
 
336 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2434  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.62 
 
 
318 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52 
 
 
315 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3808  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.69 
 
 
341 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.68 
 
 
317 aa  291  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.25 
 
 
311 aa  290  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.62 
 
 
313 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.69 
 
 
341 aa  289  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0733  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.53 
 
 
311 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  50.15 
 
 
326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.31 
 
 
323 aa  289  6e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2521  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.31 
 
 
343 aa  288  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.191298 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0385  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.31 
 
 
343 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0867  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.31 
 
 
343 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0838  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.31 
 
 
343 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.677096  hitchhiker  0.0028837 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.69 
 
 
323 aa  288  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.69 
 
 
323 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3965  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.31 
 
 
381 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.603902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.09 
 
 
336 aa  287  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.39 
 
 
313 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0757  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.31 
 
 
343 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305012 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.31 
 
 
343 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0941  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.55 
 
 
328 aa  287  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>