More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17920 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  100 
 
 		 138 aa  273  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  76.81 
 
 		 138 aa  215  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  72.99 
 
 		 138 aa  204  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  63.24 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  58.7 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  58.7 
 
 		 136 aa  164  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  60.15 
 
 		 153 aa  161  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  60.47 
 
 		 139 aa  156  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  55.47 
 
 		 137 aa  155  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  55.88 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  55.4 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  55.15 
 
 		 135 aa  148  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  59.69 
 
 		 136 aa  147  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  56.62 
 
 		 138 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  54.41 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  58.21 
 
 		 136 aa  144  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  54.14 
 
 		 144 aa  143  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  55.73 
 
 		 135 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  57.46 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  49.65 
 
 		 144 aa  141  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  48.53 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  49.62 
 
 		 190 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  52.76 
 
 		 153 aa  135  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  48.2 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  48.2 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  48.2 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  50.37 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  47.86 
 
 		 163 aa  130  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  49.28 
 
 		 145 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  47.1 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2334  transcription antitermination factor NusB  44.2 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  43.88 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  43.88 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  45.6 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3146  NusB antitermination factor  45.99 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121302 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  39.84 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14710  transcription antitermination factor NusB  42.54 
 
 		 178 aa  104  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655877  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  50 
 
 		 135 aa  103  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  43.41 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  49.46 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  36.84 
 
 		 134 aa  96.7  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  44.19 
 
 		 183 aa  95.9  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  44.19 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  42.42 
 
 		 195 aa  94.4  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  35.11 
 
 		 143 aa  93.6  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  36.29 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  38.89 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  40.3 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  37.98 
 
 		 155 aa  90.9  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  41.86 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  36.76 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  31.82 
 
 		 156 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  36.03 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  36.15 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  34.85 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  36.03 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  44.19 
 
 		 134 aa  87.4  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  32.17 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  36.96 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  34.13 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  42.45 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  40 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  38.46 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  37.21 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  34.59 
 
 		 154 aa  83.6  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  32.56 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  37.3 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  29.1 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  29.1 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  28.79 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  28.36 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  33.59 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  34.09 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  33.59 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  39.18 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  38.95 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  35.43 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  32.61 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  35.25 
 
 		 150 aa  76.6  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  40.24 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  35.48 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0541  transcription antitermination protein NusB  31.3 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  45.45 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  29.77 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  27.82 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  31.5 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  38.89 
 
 		 325 aa  74.7  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  40.23 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  31.11 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  35.34 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0985  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  35.94 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  35.94 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  32.58 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  39.74 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  39.74 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  31.78 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>