More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17750 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  100 
 
 		 397 aa  810    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  79.14 
 
 		 378 aa  586  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  72.12 
 
 		 566 aa  583  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  72.93 
 
 		 382 aa  532  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  74.29 
 
 		 362 aa  531  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  59.12 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  65.29 
 
 		 367 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  55.24 
 
 		 360 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  57.31 
 
 		 372 aa  402  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  56.21 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  56.32 
 
 		 366 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  55.11 
 
 		 366 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  54.95 
 
 		 365 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  58.97 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  56.03 
 
 		 366 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  56.32 
 
 		 366 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  53.91 
 
 		 366 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  56.61 
 
 		 368 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  55.71 
 
 		 351 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  54.07 
 
 		 349 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  55.11 
 
 		 366 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  56.01 
 
 		 365 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  56.65 
 
 		 344 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  56.21 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  53.76 
 
 		 374 aa  391  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  57.14 
 
 		 363 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  52.2 
 
 		 372 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  51.6 
 
 		 374 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  54.91 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  54.83 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  52.53 
 
 		 374 aa  382  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  54.25 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  54.91 
 
 		 357 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  54.04 
 
 		 368 aa  383  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  52.25 
 
 		 362 aa  383  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  53.2 
 
 		 349 aa  381  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  50.27 
 
 		 375 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  52.19 
 
 		 403 aa  382  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  54.25 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  53.37 
 
 		 345 aa  378  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  55.99 
 
 		 345 aa  378  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  52.6 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  52.87 
 
 		 365 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  52.02 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  55.15 
 
 		 347 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  57.31 
 
 		 339 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  52.31 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  51.67 
 
 		 383 aa  375  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  55.33 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  55.39 
 
 		 345 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  54.36 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  54.14 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  54.18 
 
 		 351 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  55.39 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  53.96 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  53.49 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  54.63 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  55.39 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  54.14 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  54.49 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  54.22 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  51.29 
 
 		 351 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  54.49 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  56.23 
 
 		 345 aa  371  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  54.57 
 
 		 347 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  55.09 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  54.49 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  54.49 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  50.13 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  53.96 
 
 		 347 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  53.96 
 
 		 347 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  50.53 
 
 		 372 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  53.96 
 
 		 347 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  53.71 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  53.43 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  54.79 
 
 		 345 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  54.79 
 
 		 345 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  55.09 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  52.41 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  54.79 
 
 		 345 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  57.1 
 
 		 347 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  54.25 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  53.37 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  55.17 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  53.76 
 
 		 347 aa  368  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  53.45 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  53.75 
 
 		 344 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  54.46 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  54.55 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  54.25 
 
 		 347 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  56.16 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  51.52 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  53.31 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  54.55 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  53.08 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  55.56 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  54.79 
 
 		 345 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  55.35 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  55.56 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1695  twitching motility protein  51.74 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>