166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_16970 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  100 
 
 		 313 aa  627  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  42.81 
 
 		 644 aa  247  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  39.56 
 
 		 330 aa  202  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  39.37 
 
 		 324 aa  198  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  40.07 
 
 		 487 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  36.81 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  37.37 
 
 		 348 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  34.56 
 
 		 533 aa  159  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  38.05 
 
 		 1186 aa  153  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  35.76 
 
 		 468 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  33.92 
 
 		 509 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  34.84 
 
 		 317 aa  149  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  33.44 
 
 		 464 aa  145  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  34.9 
 
 		 618 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  34.68 
 
 		 315 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  34.24 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.83 
 
 		 444 aa  142  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  31.37 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  34.34 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  35.23 
 
 		 450 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  32.89 
 
 		 524 aa  136  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  30.99 
 
 		 315 aa  133  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  32.63 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  31.72 
 
 		 401 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  33.05 
 
 		 527 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  31.16 
 
 		 302 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  33 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.36 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  28.67 
 
 		 535 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  32.8 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  29.81 
 
 		 383 aa  112  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  29.39 
 
 		 679 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.75 
 
 		 344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.13 
 
 		 330 aa  109  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  28.98 
 
 		 325 aa  108  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.91 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  31.29 
 
 		 1338 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  31.67 
 
 		 345 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  26.32 
 
 		 384 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  29.65 
 
 		 344 aa  99.8  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.04 
 
 		 346 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.18 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  29.05 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.62 
 
 		 346 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  25.67 
 
 		 393 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  29.63 
 
 		 385 aa  96.3  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  30.03 
 
 		 319 aa  95.9  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.91 
 
 		 712 aa  94.7  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  33.1 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  29.64 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  31.1 
 
 		 505 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  28.52 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 855 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  29.24 
 
 		 667 aa  85.1  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  30.04 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  26.33 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  26.33 
 
 		 472 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  28.82 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  29.46 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  26.12 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  29.43 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.52 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  26.45 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  26.45 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.53 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.94 
 
 		 577 aa  65.9  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  27.48 
 
 		 556 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  27.73 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.36 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.36 
 
 		 547 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  29.81 
 
 		 550 aa  63.9  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.6 
 
 		 523 aa  63.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  26.75 
 
 		 512 aa  63.5  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  28.98 
 
 		 475 aa  63.2  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  26.93 
 
 		 829 aa  63.2  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  24.2 
 
 		 563 aa  62.8  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  24.79 
 
 		 404 aa  62.4  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  25.64 
 
 		 532 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.03 
 
 		 517 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  30.49 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  28.1 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  24.49 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  26.37 
 
 		 511 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.27 
 
 		 540 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  26.28 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  23 
 
 		 581 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  25.27 
 
 		 535 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  25.95 
 
 		 713 aa  59.7  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  28.93 
 
 		 503 aa  59.7  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  26.74 
 
 		 566 aa  59.7  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  26.13 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  26.07 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  25.78 
 
 		 504 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  26.17 
 
 		 451 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.92 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  27.7 
 
 		 547 aa  55.8  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>