More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_16280 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  100 
 
 		 276 aa  530  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  53.39 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  42.52 
 
 		 222 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  50.83 
 
 		 224 aa  148  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  33.75 
 
 		 227 aa  130  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  42.26 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  42.68 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  36.7 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  40.69 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  40.38 
 
 		 234 aa  123  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  36.07 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  39.82 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  37.22 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  40.49 
 
 		 235 aa  119  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  38.06 
 
 		 236 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  38.06 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  33.76 
 
 		 236 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  38.16 
 
 		 241 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  42.44 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  38.02 
 
 		 237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  37.65 
 
 		 236 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  36.48 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  34.95 
 
 		 230 aa  115  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  37.65 
 
 		 236 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  37.96 
 
 		 236 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  43.52 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  35.22 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  39.25 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  37.65 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  37.02 
 
 		 231 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  37.86 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  37.25 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  38.27 
 
 		 236 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  36.79 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  35.12 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  38.62 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  44.16 
 
 		 232 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  36.84 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  36.84 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  36.84 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  36.84 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  36.84 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  30.19 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  36.84 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  36.84 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  36.44 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  26.75 
 
 		 229 aa  109  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 		 239 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  33.79 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  35.48 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  31.67 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  41.67 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  42.05 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  39 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  40.62 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  38.12 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  38.38 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  32.86 
 
 		 245 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  32.41 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  36.41 
 
 		 231 aa  105  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  32.31 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  35.94 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  35.94 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  32.67 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  38.59 
 
 		 231 aa  102  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  35.83 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  37.97 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 235 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  33.76 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  33.87 
 
 		 238 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  44.67 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  41.58 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  34.3 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  34.3 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  40.59 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1954  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 		 238 aa  100  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.370559  normal  0.016574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  40.14 
 
 		 229 aa  99.4  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  39.44 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  33.73 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  35.59 
 
 		 246 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  36.42 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  35.64 
 
 		 238 aa  96.3  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31460  GMP synthase family protein  38.68 
 
 		 248 aa  95.9  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000828647  normal  0.202154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  39.18 
 
 		 229 aa  95.5  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  35.98 
 
 		 245 aa  95.5  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  35.14 
 
 		 209 aa  95.1  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  34.83 
 
 		 232 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  29.36 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  40.82 
 
 		 240 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  35.6 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  34.13 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  45.52 
 
 		 242 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  37.91 
 
 		 947 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  37.7 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  32.64 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  38.74 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>