More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15760 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  68.44 
 
 
600 aa  813  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  60.8 
 
 
622 aa  715  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  65 
 
 
602 aa  741  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  66.94 
 
 
603 aa  813  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  63.17 
 
 
606 aa  724  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  61.77 
 
 
599 aa  730  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  60.73 
 
 
608 aa  706  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  60.9 
 
 
606 aa  696  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  3.27223e-05 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  100 
 
 
606 aa  1208  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  59.57 
 
 
605 aa  681  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  59.53 
 
 
604 aa  703  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  66.56 
 
 
606 aa  788  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  55.83 
 
 
616 aa  633  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  56.16 
 
 
599 aa  634  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  55.02 
 
 
599 aa  634  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  53.85 
 
 
602 aa  630  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  54.18 
 
 
599 aa  627  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  54.33 
 
 
600 aa  623  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  53.24 
 
 
597 aa  621  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  54.83 
 
 
619 aa  621  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  54.98 
 
 
602 aa  613  1e-174  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  53.58 
 
 
593 aa  611  1e-174  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  52.81 
 
 
598 aa  613  1e-174  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.17 
 
 
597 aa  609  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  51.57 
 
 
602 aa  606  1e-172  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  52.25 
 
 
599 aa  608  1e-172  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  51.91 
 
 
599 aa  590  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  50.42 
 
 
600 aa  587  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  50.91 
 
 
601 aa  587  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  51.99 
 
 
607 aa  583  1e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  52.21 
 
 
615 aa  579  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  51.68 
 
 
595 aa  576  1e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  51.74 
 
 
604 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  51.25 
 
 
599 aa  569  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  51.17 
 
 
601 aa  566  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  50.17 
 
 
597 aa  567  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  51.41 
 
 
597 aa  565  1e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  51.41 
 
 
597 aa  565  1e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  51.24 
 
 
597 aa  561  1e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 
597 aa  563  1e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  50.08 
 
 
609 aa  564  1e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  50.49 
 
 
611 aa  558  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  51.58 
 
 
600 aa  561  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  49.59 
 
 
602 aa  557  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1274  AMP-dependent synthetase and ligase  50.25 
 
 
609 aa  557  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.55356e-10 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  52.34 
 
 
591 aa  532  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  48.5 
 
 
606 aa  533  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  48.67 
 
 
596 aa  523  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  48.75 
 
 
612 aa  521  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  44 
 
 
603 aa  515  1e-145  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  48.91 
 
 
632 aa  516  1e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  2.76011e-05 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  49.91 
 
 
615 aa  514  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  47.91 
 
 
612 aa  514  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  45.92 
 
 
607 aa  504  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  42.83 
 
 
618 aa  486  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0401  long-chain acyl-CoA synthetase  43.5 
 
 
701 aa  458  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  42.24 
 
 
679 aa  453  1e-126  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0592  long-chain acyl-CoA synthetase  42.07 
 
 
677 aa  434  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0860  AMP-binding enzyme  40.55 
 
 
682 aa  431  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1932  AMP-dependent synthetase and ligase  41.89 
 
 
590 aa  421  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333973  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0944  AMP-dependent synthetase and ligase  39.55 
 
 
622 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  39.07 
 
 
607 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  37.9 
 
 
649 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  39.8 
 
 
604 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  39.97 
 
 
604 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  38.99 
 
 
606 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  39.4 
 
 
605 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  39.47 
 
 
604 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  36.93 
 
 
633 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  39.04 
 
 
652 aa  375  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 
606 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 
606 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  38.19 
 
 
617 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 
594 aa  372  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 
597 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  4.90287e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 
609 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 
622 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 
669 aa  361  2e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 
607 aa  360  3e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  33.96 
 
 
587 aa  360  5e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 
602 aa  358  1e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  35.02 
 
 
633 aa  358  2e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  38.41 
 
 
592 aa  355  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 
598 aa  352  8e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  38.05 
 
 
612 aa  352  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  38.03 
 
 
672 aa  351  2e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 
610 aa  347  4e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 
635 aa  347  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522834  normal  0.0456544 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 
610 aa  345  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.84 
 
 
610 aa  342  1e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 
610 aa  341  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 
610 aa  341  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  35.07 
 
 
613 aa  340  6e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  33.99 
 
 
607 aa  337  3e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 
630 aa  336  8e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 
685 aa  334  3e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  34.15 
 
 
592 aa  332  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  32.98 
 
 
590 aa  332  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 
602 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 
602 aa  330  5e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>