More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15260 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0695  putative amidohydrolase  61.4 
 
 
565 aa  679    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0887  NAD+ synthetase  60.87 
 
 
570 aa  684    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  100 
 
 
553 aa  1113    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1488  NAD+ synthetase  71.92 
 
 
553 aa  783    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1848  NAD+ synthetase  63.22 
 
 
547 aa  649    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  57.24 
 
 
599 aa  634  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07390  NAD+ synthetase  57.41 
 
 
577 aa  629  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  57.02 
 
 
571 aa  622  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  55.06 
 
 
591 aa  609  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  55.25 
 
 
591 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  54.62 
 
 
598 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  54.42 
 
 
577 aa  593  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  54.28 
 
 
582 aa  583  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  55.14 
 
 
586 aa  580  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1765  NAD+ synthetase  54.27 
 
 
601 aa  578  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  hitchhiker  0.000901061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.56 
 
 
597 aa  575  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  53.87 
 
 
611 aa  569  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  52.97 
 
 
590 aa  567  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  52.99 
 
 
584 aa  553  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3146  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  51.49 
 
 
606 aa  551  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.814025  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4955  NAD+ synthetase  51.64 
 
 
586 aa  528  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5512  NAD+ synthetase  48.72 
 
 
583 aa  488  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.362156  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  45.67 
 
 
552 aa  473  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  45.1 
 
 
561 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  46.87 
 
 
540 aa  465  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  46.82 
 
 
539 aa  463  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  46.86 
 
 
554 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  44.92 
 
 
566 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  47.66 
 
 
556 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  44.67 
 
 
587 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  44.4 
 
 
567 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  44.4 
 
 
567 aa  457  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  43.55 
 
 
542 aa  456  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  44.01 
 
 
545 aa  456  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  44.23 
 
 
566 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  47.11 
 
 
537 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  43.37 
 
 
542 aa  452  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.95 
 
 
543 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  47.17 
 
 
559 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  46.1 
 
 
539 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  47.3 
 
 
546 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.6 
 
 
566 aa  450  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  45.8 
 
 
545 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  45.39 
 
 
561 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  40.27 
 
 
573 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  47.19 
 
 
550 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  45.83 
 
 
583 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  42.27 
 
 
566 aa  439  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  39.42 
 
 
574 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  44.92 
 
 
564 aa  442  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  42.26 
 
 
583 aa  441  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  42.2 
 
 
576 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  40.37 
 
 
575 aa  439  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3756  NAD+ synthetase  42.91 
 
 
573 aa  436  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  44.88 
 
 
552 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  43.55 
 
 
538 aa  436  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  46.36 
 
 
585 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  42.16 
 
 
576 aa  437  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  46.73 
 
 
571 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  45.36 
 
 
546 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  46.52 
 
 
585 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  46.49 
 
 
554 aa  433  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  45.44 
 
 
554 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.34 
 
 
577 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  46.31 
 
 
554 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  46.33 
 
 
539 aa  430  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  43.14 
 
 
536 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  45.52 
 
 
545 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  45.18 
 
 
572 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  45.34 
 
 
545 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  45.65 
 
 
587 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  45.74 
 
 
576 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  44.38 
 
 
538 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  44.76 
 
 
583 aa  427  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  44.88 
 
 
566 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  44.97 
 
 
587 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  43.19 
 
 
562 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  45.36 
 
 
572 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  44.94 
 
 
541 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  45.36 
 
 
572 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  44.78 
 
 
544 aa  427  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  45.91 
 
 
547 aa  427  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  43.39 
 
 
565 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  46.58 
 
 
567 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  44.11 
 
 
609 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  44.42 
 
 
566 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  42.96 
 
 
536 aa  425  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  44.42 
 
 
566 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  44.42 
 
 
566 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  45.45 
 
 
566 aa  425  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  44.89 
 
 
568 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  44.48 
 
 
571 aa  423  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  43.01 
 
 
540 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  44.48 
 
 
562 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  43.65 
 
 
559 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  43.35 
 
 
540 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  44.42 
 
 
566 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  44.42 
 
 
566 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  43.35 
 
 
540 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  44.11 
 
 
609 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>